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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2cjk | ||||||
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タイトル | Structure of the RNA binding domain of Hrp1 in complex with RNA | ||||||
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![]() | RNA BINDING PROTEIN / HRP1 / RNA-BINDING / RNA PROCESSING / MRNA PROCESSING / NONSENSE-MEDIATED MRNA DECAY / CLEAVAGE / POLYADENYLATION / NUCLEAR PROTEIN / RNA-BINDING PROTEIN | ||||||
機能・相同性 | ![]() response to DNA damage checkpoint signaling / mRNA cleavage factor complex / nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay / cytoplasmic stress granule / mRNA processing / mRNA binding / RNA binding / nucleus / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / XPLOR-NIH, CNS | ||||||
![]() | Perez-Canadillas, J.M. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Grabbing the message: structural basis of mRNA 3'UTR recognition by Hrp1. 著者: Perez-Canadillas, J.M. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 1.4 MB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 1.2 MB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 19065.559 Da / 分子数: 1 / 断片: RNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 156-322 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() プラスミド: PET28 / 発現宿主: ![]() ![]() |
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#2: RNA鎖 | 分子量: 2496.529 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) ![]() ![]() |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: NONE |
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試料調製
詳細 | 内容: 95% WATER/5% D2O | ||||||||||||||||||||
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試料状態 |
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-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: XPLOR-NIH, CNS / ソフトェア番号: 1 | |||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: COMPARISON BETWEEN ENERGY- ORDERED RMSD PROFILES AND TOTAL ENERGY 計算したコンフォーマーの数: 50 / 登録したコンフォーマーの数: 25 |