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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2cdv | ||||||||||||
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タイトル | REFINED STRUCTURE OF CYTOCHROME C3 AT 1.8 ANGSTROMS RESOLUTION | ||||||||||||
![]() | CYTOCHROME C3 | ||||||||||||
![]() | HEME PROTEIN OF ELECTRON TRANSPORT | ||||||||||||
機能・相同性 | ![]() anaerobic respiration / periplasmic space / electron transfer activity / heme binding / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||||||||
生物種 | ![]() | ||||||||||||
手法 | ![]() | ||||||||||||
![]() | Higuchi, Y. / Kusunoki, M. / Matsuura, Y. / Yasuoka, N. / Kakudo, M. | ||||||||||||
![]() | ![]() タイトル: Refined structure of cytochrome c3 at 1.8 A resolution 著者: Higuchi, Y. / Kusunoki, M. / Matsuura, Y. / Yasuoka, N. / Kakudo, M. #1: ![]() タイトル: On Cytochrome C3 Folding 著者: Higuchi, Y. / Kusunoki, M. / Yasuoka, N. / Kakudo, M. / Yagi, T. #2: ![]() タイトル: The Structure of Cytochrome C3 from Desulfovibrio Vulgaris Miyazaki at 2.5 Angstroms Resolution 著者: Higuchi, Y. / Bando, S. / Kusunoki, M. / Matsuura, Y. / Yasuoka, N. / Kakudo, M. / Yamanaka, T. / Yagi, T. / Inokuchi, H. #3: ![]() タイトル: Amino Acid Sequence of Cytochrome C3 from Desulfovibrio Vulgaris, Miyazaki 著者: Shinkai, W. / Hase, T. / Yagi, T. / Matsubara, H. #4: ![]() タイトル: Crystallographic Data for Cytochrome C3 from Two Strains of Desulfovibrio Vulgaris, Miyazaki 著者: Bando, S. / Matsuura, Y. / Tanaka, N. / Yasuoka, N. / Kakudo, M. / Yagi, T. / Inokuchi, H. | ||||||||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 33.6 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 26.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 659.7 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 668.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 5.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 7.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 11557.297 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 参照: UniProt: P00132 | ||
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#2: 化合物 | ChemComp-HEC / #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.72 Å3/Da / 溶媒含有率: 54.76 % | |||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 温度: 11 ℃ / pH: 7.3 / 手法: 蒸気拡散法 | |||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.8 Å / Num. obs: 12162 / Num. measured all: 74360 / Rmerge(I) obs: 0.043 |
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解析
精密化 | 最高解像度: 1.8 Å /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 1.8 Å
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精密化 | *PLUS 最低解像度: 6 Å / Rfactor obs: 0.176 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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