OXYGEN TRANSPORT / DROSOPHILA MELANOGASTER HEMOGLOBIN / HEME HEXACOORDINATION / INSECT HEMOGLOBIN / PROTEIN CAVITIES / PROTEIN STRUCTURE OXYGEN TRANSPORT
機能・相同性
機能・相同性情報
lactoperoxidase activity / peroxidase / oxygen transport / oxygen carrier activity / oxygen binding / peroxidase activity / response to hypoxia / iron ion binding / heme binding / plasma membrane / cytoplasm 類似検索 - 分子機能
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 0.973 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 1.2→20 Å / Num. obs: 36706 / % possible obs: 87.9 % / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 4 % / Rmerge(I) obs: 0.13 / Net I/σ(I): 12
反射 シェル
解像度: 1.2→1.26 Å / 冗長度: 3 % / Rmerge(I) obs: 0.11 / Mean I/σ(I) obs: 7 / % possible all: 92
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
REFMAC
5.2.0003
精密化
MOSFLM
データ削減
SCALA
データスケーリング
精密化
構造決定の手法: OTHER 開始モデル: NONE 解像度: 1.2→28.75 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.982 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.977 / SU B: 0.862 / SU ML: 0.018 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.037 / ESU R Free: 0.038 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS.
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.134
1800
5 %
RANDOM
Rwork
0.101
-
-
-
obs
0.102
34149
86.1 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK