登録情報 データベース : PDB / ID : 2bf6 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Atomic Resolution Structure of the bacterial sialidase NanI from Clostridium perfringens in complex with alpha-Sialic Acid (Neu5Ac). 要素EXO-ALPHA-SIALIDASE 詳細 キーワード HYDROLASE / SIALIDASE / CLOSTRIDIUM PERFRINGENS / SIALIC ACID機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
ganglioside catabolic process / oligosaccharide catabolic process / exo-alpha-(2->3)-sialidase activity / exo-alpha-(2->6)-sialidase activity / exo-alpha-(2->8)-sialidase activity / exo-alpha-sialidase / intracellular membrane-bounded organelle / membrane / metal ion binding / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 BNR repeat-like domain / Intramolecular trans-sialidase; domain 3 / Intramolecular Trans-sialidase; Domain 3 / Trans-sialidase, domain 3 / Glycoside hydrolase, family 33, N-terminal / Sialidase, N-terminal domain / BNR repeat-like domain / Sialidase family / Sialidase / Neuraminidase - #10 ... BNR repeat-like domain / Intramolecular trans-sialidase; domain 3 / Intramolecular Trans-sialidase; Domain 3 / Trans-sialidase, domain 3 / Glycoside hydrolase, family 33, N-terminal / Sialidase, N-terminal domain / BNR repeat-like domain / Sialidase family / Sialidase / Neuraminidase - #10 / Sialidase superfamily / 6 Propeller / Neuraminidase / Concanavalin A-like lectin/glucanase domain superfamily / Beta Barrel / Mainly Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 N-acetyl-alpha-neuraminic acid / exo-alpha-sialidase 類似検索 - 構成要素生物種 Clostridium perfringens (ウェルシュ菌)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 0.97 Å 詳細データ登録者 Newstead, S. / Taylor, G.L. 引用ジャーナル : J.Biol.Chem. / 年 : 2008タイトル : The Structure of Clostridium Perfringens Nani Sialidase and its Catalytic Intermediates.著者 : Newstead, S.L. / Potter, J.A. / Wilson, J.C. / Xu, G. / Chien, C.H. / Watts, A.G. / Withers, S.G. / Taylor, G.L. 履歴 登録 2004年12月4日 登録サイト : PDBE / 処理サイト : PDBE改定 1.0 2006年3月9日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2011年5月8日 Group : Version format compliance改定 1.2 2011年7月13日 Group : Version format compliance改定 1.3 2018年3月7日 Group : Advisory / Source and taxonomy / カテゴリ : entity_src_gen / pdbx_unobs_or_zero_occ_atomsItem : _entity_src_gen.pdbx_gene_src_scientific_name / _entity_src_gen.pdbx_host_org_ncbi_taxonomy_id ... _entity_src_gen.pdbx_gene_src_scientific_name / _entity_src_gen.pdbx_host_org_ncbi_taxonomy_id / _entity_src_gen.pdbx_host_org_scientific_name / _entity_src_gen.pdbx_host_org_strain / _entity_src_gen.pdbx_host_org_variant 改定 1.4 2019年5月22日 Group : Data collection / Refinement description / カテゴリ : refine / Item : _refine.pdbx_ls_cross_valid_method改定 1.5 2020年7月29日 Group : Data collection / Derived calculations ... Data collection / Derived calculations / Other / Structure summary カテゴリ : chem_comp / entity ... chem_comp / entity / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_database_status / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_site / struct_site_gen Item : _chem_comp.name / _chem_comp.type ... _chem_comp.name / _chem_comp.type / _entity.pdbx_description / _pdbx_database_status.status_code_sf / _pdbx_entity_nonpoly.name / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id 解説 : Carbohydrate remediation / Provider : repository / タイプ : Remediation改定 1.6 2023年12月13日 Group : Advisory / Data collection ... Advisory / Data collection / Database references / Refinement description / Structure summary カテゴリ : chem_comp / chem_comp_atom ... chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms Item : _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession
すべて表示 表示を減らす Remark 700 SHEET THE SHEET STRUCTURE OF THIS MOLECULE IS BIFURCATED. IN ORDER TO REPRESENT THIS FEATURE IN ... SHEET THE SHEET STRUCTURE OF THIS MOLECULE IS BIFURCATED. IN ORDER TO REPRESENT THIS FEATURE IN THE SHEET RECORDS BELOW, TWO SHEETS ARE DEFINED.