PDB-2awa: Crystal structure of DNA polymerase III, beta chain (EC 2.7.7.7) ...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 2awa

タイトル

Crystal structure of DNA polymerase III, beta chain (EC 2.7.7.7) (np_344555.1) from STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE TIGR4 at 2.50 A resolution

要素

DNA polymerase III, beta chain

キーワード

TRANSFERASE / np_344555.1 / DNA polymerase III / beta chain (EC 2.7.7.7) / Structural Genomics / Joint Center for Structural Genomics / JCSG / Protein Structure Initiative / PSI

機能・相同性

機能・相同性情報

DNA polymerase III complex / 3'-5' exonuclease activity / DNA replication / DNA-directed DNA polymerase activity / DNA binding / cytoplasm
類似検索 - 分子機能

生物種

Streptococcus pneumoniae (肺炎レンサ球菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

多波長異常分散,

分子置換 /

多波長異常分散 / 解像度: 2.5 Å

データ登録者

Joint Center for Structural Genomics (JCSG)

引用

ジャーナル: To be published
タイトル: Crystal structure of DNA polymerase III, beta chain (EC 2.7.7.7) (np_344555.1) from STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE TIGR4 at 2.50 A resolution
著者: Joint Center for Structural Genomics (JCSG)

履歴

登録	2005年8月31日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2005年9月20日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2008年5月1日	Group: Version format compliance
改定 1.2	2011年7月13日	Group: Advisory / Source and taxonomy / Version format compliance
改定 1.3	2023年1月25日	Group: Database references / Derived calculations カテゴリ: database_2 / struct_conn ...database_2 / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id
改定 1.4	2023年9月20日	Group: Data collection / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model / struct_ncs_dom_lim Item: _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id
改定 1.5	2023年11月15日	Group: Data collection / カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / Item: _chem_comp_atom.atom_id / _chem_comp_bond.atom_id_2

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	2awa.cif.gz	296.1 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb2awa.ent.gz	237.8 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	2awa.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

文書・要旨	2awa_validation.pdf.gz	466.4 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	2awa_full_validation.pdf.gz	473.1 KB	表示
XML形式データ	2awa_validation.xml.gz	51.3 KB	表示
CIF形式データ	2awa_validation.cif.gz	72 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/aw/2awa ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/aw/2awa	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	1mmiS S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	6man-d 6ap4-8 6dm6-d 4s3i-2 6jir-2 3p16-3 6izo-d 6ap4-4 6ap4-5 4k3l-d 4tr6-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索
その他のデータベース	TargetDB: 358603

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#150 - 2012年6月スライディングクランプ (Sliding Clamps) 類似性 (8)

登録構造単位

A: DNA polymerase III, beta chain

B: DNA polymerase III, beta chain

C: DNA polymerase III, beta chain

D: DNA polymerase III, beta chain

ヘテロ分子

175 kDa, 4 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

A: DNA polymerase III, beta chain

B: DNA polymerase III, beta chain

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
87.6 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

2

C: DNA polymerase III, beta chain

D: DNA polymerase III, beta chain

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
87.5 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	94.060, 70.720, 135.440
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 91.040, 90.000
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
1	1	A
2	1	B
3	1	C
4	1	D

NCSドメイン領域:

Component-ID: 1 / Ens-ID: 1 / Beg auth comp-ID: MSE / Beg label comp-ID: MSE / End auth comp-ID: ARG / End label comp-ID: ARG / Refine code: 6 / Auth seq-ID: 1 - 376 / Label seq-ID: 13 - 388

Dom-ID	Auth asym-ID	Label asym-ID
1	A	A
2	B	B
3	C	C
4	D	D

#1: タンパク質	DNA polymerase III, beta chain 分子量: 43763.711 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Streptococcus pneumoniae (肺炎レンサ球菌) 株: TIGR4 / 遺伝子: dnaN / プラスミド: HK100 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: O06672, DNA-directed DNA polymerase
#2: 化合物	ChemComp-GOL / GLYCEROL / GLYCERIN / PROPANE-1,2,3-TRIOL / グリセロ-ル分子量: 92.094 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃H₈O₃
#3: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 251 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.76 Å³/Da / 溶媒含有率: 55.16 % 解説: THE EXPERIMENTAL MAD MAP IS POOR WITHOUT NCS AVERAGING. A MONOMER POLY-ALANINE MODEL OF 1MMI IS USED AS TEMPLATE FOR THE LOCATION OF FOUR MONOMERS IN THE EXPERIMENTAL MAP. THE MAD MAP IS ...解説: THE EXPERIMENTAL MAD MAP IS POOR WITHOUT NCS AVERAGING. A MONOMER POLY-ALANINE MODEL OF 1MMI IS USED AS TEMPLATE FOR THE LOCATION OF FOUR MONOMERS IN THE EXPERIMENTAL MAP. THE MAD MAP IS SIGNIFICANTLY IMPROVED WITH NCS AVERAGING WHICH ALLOWS THE COMPLETION OF THE MODEL FROM THE INITIAL PHASED MOLECULAR REPLACEMENT SOLUTION. THE IMPROVED PHASES RESULTING FROM NCS AVERAGING WERE USED AS PHASE RESTRAINTS IN THE REFMAC REFINEMENT.
結晶化	温度: 277 K 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法, nanodrop pH: 7.5 詳細: 10.0% iso-Propanol, 20.0% PEG-4000, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION,SITTING DROP,NANODROP, temperature 277K

結晶

マシュー密度: 2.76 Å³/Da / 溶媒含有率: 55.16 %
解説: THE EXPERIMENTAL MAD MAP IS POOR WITHOUT NCS AVERAGING. A MONOMER POLY-ALANINE MODEL OF 1MMI IS USED AS TEMPLATE FOR THE LOCATION OF FOUR MONOMERS IN THE EXPERIMENTAL MAP. THE MAD MAP IS ...

結晶化

温度: 277 K
手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法, nanodrop
pH: 7.5
詳細: 10.0% iso-Propanol, 20.0% PEG-4000, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION,SITTING DROP,NANODROP, temperature 277K

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

SSRL

/ ビームライン: BL9-2 / 波長: 0.97934, 0.91837, 0.97923

検出器

タイプ: MARMOSAIC 325 mm CCD / 検出器: CCD / 日付: 2005年6月2日

放射

プロトコル: MAD / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

ID	波長 (Å)	相対比
1	0.97934	1
2	0.91837	1
3	0.97923	1

反射

解像度: 2.5→48.9 Å / Num. obs: 59570 / % possible obs: 91.1 % / R_merge(I) obs: 0.088 / Net I/σ(I): 8

反射シェル

解像度 (Å)	% possible obs (%)	R_merge(I) obs	Mean I/σ(I) obs	Num. measured obs	Num. unique obs	Diffraction-ID
2.5-2.6	74.4	0.678	1.85	18897	10004	1
2.6-2.79	86.8	0.678	2.43	34577	17756	1
2.79-2.9	90	0.678	3.16	16518	8495	1
2.9-3.03	92.1	0.678	4.15	17374	8872	1
3.03-3.19	94.3	0.678	5.63	17892	9136	1
3.19-3.39	95.5	0.678	7.33	18197	9280	1
3.39-3.65	97.2	0.678	9.86	18347	9328	1
3.65-4.01	97.4	0.678	12	18407	9290	1
4.01-4.59	96.7	0.678	14.95	18866	9431	1
4.59-5.75	95.9	0.678	15.56	18566	9192	1
5.75-48.9	93.1	0.678	16.04	18874	9262	1

-
位相決定

位相決定	手法: 多波長異常分散

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
REFMAC	5.2.0005	精密化
XSCALE		データスケーリング
PDB_EXTRACT	1.601	データ抽出
XDS		データ削減
SHELXD		位相決定
autoSHARP		位相決定
MOLREP		位相決定

精密化

構造決定の手法:

多波長異常分散,

分子置換
開始モデル: 1MMI

1mmi

解像度: 2.5→30 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.955 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.924 / SU B: 21.693 / SU ML: 0.229 / TLS residual ADP flag: LIKELY RESIDUAL / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.535 / ESU R Free: 0.292
立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD WITH PHASES
詳細: 1. HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS 2. MANY SURFACE SIDE CHAINS ARE TRIMMED DUE TO LACK OF DEFINITIVE ELECTRON DENSITIES.

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.25	3044	5.1 %	RANDOM
R_work	0.192	-	-	-
all	0.195	-	-	-
obs	-	56494	48.91 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK

原子変位パラメータ

B_iso mean: 60.175 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	-0.36 Å²	0 Å²	-2.72 Å²
2-	-	-2.04 Å²	0 Å²
3-	-	-	2.3 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.5→30 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	11381	0	6	251	11638

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.012	0.022	11558
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d	0.001	0.02	10748
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.294	1.964	15724
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg	0.735	3	24915
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	6.467	5	1505
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	37.874	25.174	431
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	15.183	15	1981
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	16.323	15	45
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.073	0.2	1990
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.004	0.02	12717
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other	0.001	0.02	2153
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined	0.202	0.2	1926
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_other	0.173	0.2	10364
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined	0.174	0.2	5674
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_other	0.083	0.2	7488
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined	0.146	0.2	321
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_refined	0.071	0.2	7
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_other	0.206	0.2	45
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_refined	0.073	0.2	2
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	1.542	3	7763
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other	0.291	3	3026
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	2.551	5	12296
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	4.657	8	4175
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it	7.047	11	3428

Refine LS restraints NCS

Ens-ID: 1 / 数: 5342 / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

Dom-ID	Auth asym-ID	タイプ	Rms dev position (Å)	Weight position
1	A	loose positional	0.48	5
2	B	loose positional	0.47	5
3	C	loose positional	0.49	5
4	D	loose positional	0.54	5
1	A	loose thermal	2.05	10
2	B	loose thermal	1.97	10
3	C	loose thermal	2.09	10
4	D	loose thermal	1.9	10

LS精密化シェル

解像度: 2.5→2.564 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.407	203	-
R_work	0.3	3580	-
obs	-	-	83.86 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	3.9475	0.1793	0.0004	3.3612	0.1519	1.3593	0.0429	0.1761	-0.0697	-0.1293	-0.0952	-0.0066	-0.0915	-0.0622	0.0524	-0.3304	0.0088	0.1127	-0.3192	0.0051	-0.4137	18.768	36.102	-9.22
2	2.3731	0.3558	0.6446	3.2555	1.4501	2.3371	0.047	0.0924	-0.1548	-0.0268	0.0597	-0.383	-0.0206	0.2614	-0.1067	-0.3186	-0.0085	0.0862	-0.3062	0.012	-0.2209	45.39	40.013	3.642
3	4.7236	-0.2155	-1.1924	2.4365	0.0012	3.6164	0.1022	-0.3864	0.0167	0.294	0.0302	-0.1636	0.1909	0.3972	-0.1324	-0.1842	-0.0134	-0.0587	-0.1642	0.0243	-0.1727	46.477	47.281	31.188
4	6.6505	-0.176	0.3845	2.7241	0.167	1.7343	-0.299	-0.5666	0.3665	0.1273	0.1372	0.0432	-0.1078	0.1173	0.1618	-0.0965	0.0086	0.0266	-0.1258	0.0372	-0.3461	19.342	51.562	44.119
5	2.3568	0.0914	1.4848	2.5539	-0.4695	3.3884	-0.1238	-0.3977	-0.0798	0.4555	0.035	0.0683	-0.1565	-0.2381	0.0888	-0.2368	0.0167	0.1585	-0.1597	0.1031	-0.3075	-7.579	47.224	31.165
6	3.3608	-0.6287	-1.342	2.8419	0.8139	3.9143	0.0727	0.0688	-0.3541	0.0265	-0.228	0.2169	0.2157	-0.249	0.1553	-0.3359	-0.0357	0.073	-0.2313	0.0046	-0.204	-8.368	38.413	4.323
7	7.2985	0.6622	-0.0572	2.9792	-0.0375	1.7147	0.0297	0.8699	0.3679	-0.2271	0.1084	-0.0051	0.0177	-0.05	-0.1381	-0.0033	0.0183	-0.1168	-0.077	0.0168	-0.2257	22.729	18.054	24.357
8	3.1172	-0.4393	0.7302	2.1137	0.1825	3.638	-0.1364	0.3269	0.0731	-0.5359	0.0085	0.1394	-0.1483	0.2791	0.1279	-0.1304	-0.0228	0.0421	-0.1555	-0.068	-0.2701	50.122	11.353	34.572
9	4.4312	0.9744	-0.9472	3.235	-1.2666	4.6298	0.1326	-0.3869	-0.3734	-0.0215	-0.2681	-0.2413	0.3218	0.3399	0.1355	-0.2793	0.0314	0.0815	-0.0587	-0.0052	-0.268	52.64	-1.144	60.058
10	6.5277	0.2124	-0.0445	2.162	-0.4177	2.6198	-0.0283	-0.4425	-0.233	-0.1365	0.0024	0.0118	0.0067	0.1872	0.0259	-0.2801	-0.0276	0.033	-0.1577	0.0666	-0.3369	26.758	-5.884	75.195
11	2.9563	-0.4545	1.3724	3.027	-1.0725	3.1931	-0.0898	-0.2793	-0.0933	-0.0077	0.0432	0.4854	-0.1506	-0.1949	0.0466	-0.207	0.0233	-0.0411	-0.2684	-0.026	-0.1464	-0.493	0.838	64.973
12	4.2188	0.3473	-0.475	3.066	-0.7912	4.351	0.0511	0.2754	0.0707	-0.2896	0.0993	0.1827	0.1603	-0.3598	-0.1504	-0.0406	0.0012	-0.2392	-0.2565	-0.0136	-0.0988	-3.014	12.131	38.87

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	A	1 - 125	13 - 137
2	X-RAY DIFFRACTION	2	A	A	126 - 256	138 - 268
3	X-RAY DIFFRACTION	3	A	A	257 - 377	269 - 389
4	X-RAY DIFFRACTION	4	B	B	0 - 125	12 - 137
5	X-RAY DIFFRACTION	5	B	B	126 - 256	138 - 268
6	X-RAY DIFFRACTION	6	B	B	257 - 376	269 - 388
7	X-RAY DIFFRACTION	7	C	C	1 - 125	13 - 137
8	X-RAY DIFFRACTION	8	C	C	126 - 256	138 - 268
9	X-RAY DIFFRACTION	9	C	C	257 - 377	269 - 389
10	X-RAY DIFFRACTION	10	D	D	0 - 125	12 - 137
11	X-RAY DIFFRACTION	11	D	D	126 - 256	138 - 268
12	X-RAY DIFFRACTION	12	D	D	257 - 376	269 - 388

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

すべてのお知らせ

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
位相決定

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)

-ムービー

-構造ビューア

+ビューアのログ

-このページ

-このウェブサイト

-オプション

+データを開く

-基本情報

-構造の表示

-ダウンロードとリンク

-ダウンロード

-検証レポート

-関連構造データ

-リンク

-集合体

-要素

-実験情報

-実験

-試料調製

-データ収集

-位相決定

-解析

+万見について

-お知らせ

-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-2020年8月12日: 新型コロナ情報

+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-万見 (Yorodumi)

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
位相決定

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)