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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2aow | ||||||
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タイトル | Histamine Methyltransferase (Natural Variant I105) Complexed with the Acetylcholinesterase Inhibitor and Altzheimer's Disease Drug Tacrine | ||||||
![]() | Histamine N-methyltransferase | ||||||
![]() | TRANSFERASE / CLASSIC METHYLTRANSFERASE FOLD / PROTEIN-DRUG COMPLEX | ||||||
機能・相同性 | ![]() histamine N-methyltransferase / histamine catabolic process / histamine N-methyltransferase activity / histamine metabolic process / Histidine catabolism / L-histidine catabolic process / Metabolism of ingested SeMet, Sec, MeSec into H2Se / respiratory gaseous exchange by respiratory system / methylation / centrosome ...histamine N-methyltransferase / histamine catabolic process / histamine N-methyltransferase activity / histamine metabolic process / Histidine catabolism / L-histidine catabolic process / Metabolism of ingested SeMet, Sec, MeSec into H2Se / respiratory gaseous exchange by respiratory system / methylation / centrosome / extracellular exosome / nucleoplasm / cytoplasm / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Horton, J.R. / Sawada, K. / Nishibori, M. / Cheng, X. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structural basis for inhibition of histamine N-methyltransferase by diverse drugs 著者: Horton, J.R. / Sawada, K. / Nishibori, M. / Cheng, X. #1: ![]() タイトル: Polymorphic Forms of Human Histamine Methyltransferase: Structural, Thermal, and Kinetic Comparisons 著者: Horton, J.R. / Sawada, K. / Nishibori, M. / Zhang, X. / Cheng, X. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 122.2 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 95.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 392.5 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 411.3 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 15.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 22.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 33345.070 Da / 分子数: 2 / 断片: Histamine methyltransferase / 変異: T105I / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() #2: 化合物 | #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.58 Å3/Da / 溶媒含有率: 52.4 % |
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結晶化 | 温度: 289 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 6 詳細: PEG 6000, MES, ethyleneglycol, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 173 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: ADSC QUANTUM 4 / 検出器: CCD / 日付: 2000年4月18日 |
放射 | モノクロメーター: SI(111) DOUBLE-CRYSTAL / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.1 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.97→28 Å / Num. all: 13697 / Num. obs: 13697 / % possible obs: 99.1 % / Observed criterion σ(F): 0 / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 4.4 % / Rmerge(I) obs: 0.088 / Net I/σ(I): 13.1 |
反射 シェル | 解像度: 2.97→3.04 Å / Rmerge(I) obs: 0.213 / Num. unique all: 791 / % possible all: 98.8 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: pdb entry 1JQD 解像度: 2.97→28 Å / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / 立体化学のターゲット値: Engh & Huber
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原子変位パラメータ | Biso mean: 39.7 Å2
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Refine analyze |
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.97→28 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル | 解像度: 2.97→3.04 Å / Rfactor Rfree error: 0.044 /
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