THE PROTEIN USED IN THIS STUDY IS THE ISOZYME OF RIBONUCLEASE T1 WHERE A LYSINE RESIDUE REPLACES ...THE PROTEIN USED IN THIS STUDY IS THE ISOZYME OF RIBONUCLEASE T1 WHERE A LYSINE RESIDUE REPLACES GLUTAMINE 25 OF THE SEQUENCED RIBONUCLEASE T1 (K.TAKAHASHI, J.BIOCHEM.,V. 98, P. 815, 1985).
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実験情報
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実験
実験
手法: X線回折
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試料調製
結晶
マシュー密度: 2.08 Å3/Da / 溶媒含有率: 40.88 %
結晶化
*PLUS
pH: 7 / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法
溶液の組成
*PLUS
ID
濃度
一般名
Crystal-ID
Sol-ID
1
20mg/mL
protein
1
drop
2
20mM
Trisacetate
1
drop
3
5mM
sodiumacetate
1
drop
4
2mM
calciumacetate
1
drop
5
40 %(w/v)
PEG4000
1
reservoir
-
データ収集
反射
*PLUS
最高解像度: 1.8 Å / Rmerge(I) obs: 0.063
反射 シェル
*PLUS
最高解像度: 1.8 Å / 最低解像度: 2 Å / % possible obs: 77 %
-
解析
ソフトウェア
名称: PROLSQ / 分類: 精密化
精密化
解像度: 1.8→10 Å / σ(F): 2 /
Rfactor
反射数
obs
0.145
5986
精密化ステップ
サイクル: LAST / 解像度: 1.8→10 Å
タンパク質
核酸
リガンド
溶媒
全体
原子数
783
0
6
116
905
拘束条件
Refine-ID
タイプ
Dev ideal
X-RAY DIFFRACTION
p_bond_d
0.018
X-RAY DIFFRACTION
p_angle_d
X-RAY DIFFRACTION
p_angle_deg
X-RAY DIFFRACTION
p_planar_d
X-RAY DIFFRACTION
p_hb_or_metal_coord
X-RAY DIFFRACTION
p_mcbond_it
X-RAY DIFFRACTION
p_mcangle_it
X-RAY DIFFRACTION
p_scbond_it
X-RAY DIFFRACTION
p_scangle_it
X-RAY DIFFRACTION
p_plane_restr
X-RAY DIFFRACTION
p_chiral_restr
X-RAY DIFFRACTION
p_singtor_nbd
X-RAY DIFFRACTION
p_multtor_nbd
X-RAY DIFFRACTION
p_xhyhbond_nbd
X-RAY DIFFRACTION
p_xyhbond_nbd
X-RAY DIFFRACTION
p_planar_tor
X-RAY DIFFRACTION
p_staggered_tor
X-RAY DIFFRACTION
p_orthonormal_tor
X-RAY DIFFRACTION
p_transverse_tor
X-RAY DIFFRACTION
p_special_tor
ソフトウェア
*PLUS
名称: PROLSQ / 分類: refinement
精密化
*PLUS
最高解像度: 1.8 Å / 最低解像度: 10 Å / Num. reflection obs: 5986 / σ(F): 2 / Rfactor obs: 0.145