ソフトウェア | 名称 | バージョン | 分類 |
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X-PLOR | 3.1 | 精密化 | DENZO | | データ削減 |
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精密化 | 解像度: 3→8 Å / σ(F): 2 詳細: NUCLEIC ACID RNA-DNA PARAMETER FILE: G. PARKINSON,ET AL. (1996) ACTA CRYST. D52, 57-64
| Rfactor | 反射数 | %反射 |
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Rfree | 0.265 | - | - |
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Rwork | 0.216 | - | - |
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obs | 0.216 | 6022 | 85.4 % |
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Refine Biso | クラス: ALL ATOMS / 詳細: TR / Treatment: isotropic |
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 3→8 Å
| タンパク質 | 核酸 | リガンド | 溶媒 | 全体 |
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原子数 | 0 | 873 | 0 | 0 | 873 |
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拘束条件 | Refine-ID | タイプ | Dev ideal |
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X-RAY DIFFRACTION | x_bond_d0.007 | X-RAY DIFFRACTION | x_bond_d_na | X-RAY DIFFRACTION | x_bond_d_prot | X-RAY DIFFRACTION | x_angle_d | X-RAY DIFFRACTION | x_angle_d_na | X-RAY DIFFRACTION | x_angle_d_prot | X-RAY DIFFRACTION | x_angle_deg1.1 | X-RAY DIFFRACTION | x_angle_deg_na | X-RAY DIFFRACTION | x_angle_deg_prot | X-RAY DIFFRACTION | x_dihedral_angle_d13 | X-RAY DIFFRACTION | x_dihedral_angle_d_na | X-RAY DIFFRACTION | x_dihedral_angle_d_prot | X-RAY DIFFRACTION | x_improper_angle_d | X-RAY DIFFRACTION | x_improper_angle_d_na | X-RAY DIFFRACTION | x_improper_angle_d_prot | X-RAY DIFFRACTION | x_mcbond_it | X-RAY DIFFRACTION | x_mcangle_it | X-RAY DIFFRACTION | x_scbond_it | X-RAY DIFFRACTION | x_scangle_it | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
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Xplor file | Serial no: 1 / Param file: NDB_PARAMETER_FILE.RNA / Topol file: NDB_TOPOLOGY_FILE.RNA |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: X-PLOR / バージョン: 3.1 / 分類: refinement |
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精密化 | *PLUS 最高解像度: 3 Å / 最低解像度: 8 Å / σ(F): 2 |
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溶媒の処理 | *PLUS |
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原子変位パラメータ | *PLUS |
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拘束条件 | *PLUS Refine-ID | タイプ | Dev ideal |
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X-RAY DIFFRACTION | x_dihedral_angle_d | X-RAY DIFFRACTION | x_dihedral_angle_deg13 | X-RAY DIFFRACTION | x_planar_d1.5 | | | |
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