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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 241d | ||||||||||||||||||
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タイトル | EXTENSION OF THE FOUR-STRANDED INTERCALATED CYTOSINE MOTIF BY ADENINE.ADENINE BASE PAIRING IN THE CRYSTAL STRUCTURE OF D(CCCAAT) | ||||||||||||||||||
![]() | DNA (5'-D(*![]() DNA / U-DNA / QUADRUPLE HELIX / ARALLEL-STRANDED TETRAPLEX / BASE INTERCALATED / MISMATCHED | 機能・相同性 | DNA | ![]() 手法 | ![]() ![]() Berger, I. / Kang, C. / Fredian, A. / Ratliff, R. / Moyzis, R. / Rich, A. | ![]() ![]() タイトル: Extension of the four-stranded intercalated cytosine motif by adenine.adenine base pairing in the crystal structure of d(CCCAAT). 著者: Berger, I. / Kang, C. / Fredian, A. / Ratliff, R. / Moyzis, R. / Rich, A. 履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 15.9 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 10.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 311.6 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 320.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 2.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 3.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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要素
#1: DNA鎖 | 分子量: 1753.194 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 #2: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.24 Å3/Da / 溶媒含有率: 45.03 % | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | 温度: 277 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 6 詳細: pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.00K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 |
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結晶化 | *PLUS 温度: 4 ℃ / pH: 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 277 K |
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検出器 | タイプ: RIGAKU RAXIS IIC / 検出器: IMAGE PLATE |
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 相対比: 1 |
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解析
ソフトウェア | 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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精密化 | 解像度: 1.85→10 Å / σ(F): 2 /
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Refine Biso |
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.85→10 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS 最高解像度: 1.85 Å / 最低解像度: 10 Å / σ(F): 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |