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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1zu1 | ||||||
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タイトル | Solution Structure of the N-terminal Zinc Fingers of the Xenopus laevis double stranded RNA binding protein ZFa | ||||||
![]() | RNA binding protein ZFa | ||||||
![]() | RNA BINDING PROTEIN / zinc finger protein / helix-loop-helix / helix-turn-helix | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
![]() | Moller, H.M. / Martinez-Yamout, M.A. / Dyson, H.J. / Wright, P.E. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Solution structure of the N-terminal zinc fingers of the Xenopus laevis double-stranded RNA-binding protein ZFa 著者: Moller, H.M. / Martinez-Yamout, M.A. / Dyson, H.J. / Wright, P.E. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 764.9 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 640.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 353.7 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 438.7 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 33.9 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 62.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 14071.909 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() プラスミド: pET21a / 発現宿主: ![]() ![]() |
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#2: 化合物 |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: The protein consists of two domains that tumble more or less independently. The linker connecting both domains is completely disorderd. |
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試料調製
詳細 |
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試料状態 | イオン強度: 100mM NaCl / pH: 6.9 / 圧: ambient / 温度: 298 K |
-NMR測定
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M | ||||||||||||||||||||
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放射波長 | 相対比: 1 | ||||||||||||||||||||
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 詳細: 1142 unique NOE restraints, 216 dihedral angle restraints | ||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: fewest violations | ||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the least restraint violations 計算したコンフォーマーの数: 50 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |