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- PDB-1z1c: Structural Determinants of Tissue Tropism and In Vivo Pathogenici... -
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Open data
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Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 1z1c | |||||||||
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Title | Structural Determinants of Tissue Tropism and In Vivo Pathogenicity for the Parvovirus Minute virus of Mice | |||||||||
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![]() | Virus/DNA / Immunosuppressive strain / MVMi / Minute virus of Mice / Icosahedral virus / Virus-DNA COMPLEX | |||||||||
Function / homology | ![]() permeabilization of host organelle membrane involved in viral entry into host cell / symbiont entry into host cell via permeabilization of inner membrane / microtubule-dependent intracellular transport of viral material towards nucleus / T=1 icosahedral viral capsid / viral penetration into host nucleus / host cell / clathrin-dependent endocytosis of virus by host cell / host cell nucleus / virion attachment to host cell / structural molecule activity / metal ion binding Similarity search - Function | |||||||||
Biological species | ![]() | |||||||||
Method | ![]() ![]() ![]() | |||||||||
![]() | Kontou, M. / Govindasamy, L. / Nam, H.J. / Bryant, N. / Llamas-Saiz, A.L. / Foces-Foces, C. / Hernando, E. / Rubio, M.P. / McKenna, R. / Almendral, J.M. / Agbandje-McKenna, M. | |||||||||
![]() | ![]() Title: Structural determinants of tissue tropism and in vivo pathogenicity for the parvovirus minute virus of mice. Authors: Kontou, M. / Govindasamy, L. / Nam, H.J. / Bryant, N. / Llamas-Saiz, A.L. / Foces-Foces, C. / Hernando, E. / Rubio, M.P. / McKenna, R. / Almendral, J.M. / Agbandje-McKenna, M. #1: ![]() Title: Structure Determination of Minute Virus of Mice Authors: Llamas-Saiz, A.L. / Agbandje-McKenna, M. / Wikoff, W.R. / Bratton, J. / Tattersall, P. / Rossmann, M.G. | |||||||||
History |
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Remark 999 | SEQUENCE THE AUTHORS VERIFIED WITH THEIR COLLABORATORS THAT THE THIS DIFFERENCE BETWEEN THE CRYSTAL ...SEQUENCE THE AUTHORS VERIFIED WITH THEIR COLLABORATORS THAT THE THIS DIFFERENCE BETWEEN THE CRYSTAL COORDINATES AND SEQUENCE DATABASE IS DUE TO AN ERROR IN THE DEPOSITED SEQUENCE OR A POSSIBLE DIFFERENCE IN AN EARLIER VARIANT OF THE VIRUS. RESIDUE 366 IS A METHONINE AND THE RESIDUE 455 IS A THEORNINE. |
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Structure visualization
Structure viewer | Molecule: ![]() ![]() |
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PDBx/mmCIF format | ![]() | 142 KB | Display | ![]() |
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PDB format | ![]() | 108.3 KB | Display | ![]() |
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Others | ![]() |
-Validation report
Summary document | ![]() | 461.3 KB | Display | ![]() |
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Full document | ![]() | 504.5 KB | Display | |
Data in XML | ![]() | 19 KB | Display | |
Data in CIF | ![]() | 27.8 KB | Display | |
Arichive directory | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-Related structure data
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Assembly
Deposited unit | ![]()
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1 | ![]()
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2 |
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3 | ![]()
| x 5||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4 | ![]()
| x 6||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 | ![]()
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6 | ![]()
| x 60||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Unit cell |
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Symmetry | Point symmetry: (Hermann–Mauguin notation: 532 / Schoenflies symbol: I (icosahedral)) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS oper:
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