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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1xwp | ||||||||||||||||||||
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タイトル | Solution structure of AUCGCA loop | ||||||||||||||||||||
![]() | 5'-R(*![]() RNA / hairpin loop | 機能・相同性 | RNA / RNA (> 10) | ![]() 手法 | 溶液NMR / simulated annealing | Model type details | minimized average | ![]() Sakamoto, T. / Oguro, A. / Kawai, G. / Ohtsu, T. / Nakamura, Y. | ![]() ![]() タイトル: NMR structures of double loops of an RNA aptamer against mammalian initiation factor 4A 著者: Sakamoto, T. / Oguro, A. / Kawai, G. / Ohtsu, T. / Nakamura, Y. 履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 16.7 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 10.5 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 289 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 288.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 1.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 1.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: RNA鎖 | 分子量: 4790.929 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: This structure was determined using standard 2D homonuclear techniques. |
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試料調製
詳細 |
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試料状態 | イオン強度: 10mM / pH: 6.5 / 圧: ambient / 温度: 283 K |
-NMR測定
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M | |||||||||||||||
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放射波長 | 相対比: 1 | |||||||||||||||
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 詳細: The structure is based on a total of 215 restraints, 155 are NOE-derived distance constraints, 45 dihedral angle restraints, 11 distance restraints from hydrogen bonds, 4 base planarity restraints. | ||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: minimized average structure | ||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | 登録したコンフォーマーの数: 1 |