#1: ジャーナル: Acta Crystallogr.,Sect.D / 年: 2001 タイトル: Crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of a novel alkaline serine protease (KP-43) from alkaliphilic Bacillus sp. strain KSM-KP43 著者: Nonaka, T. / Fujihashi, M. / Kita, A. / Saeki, K. / Ito, S. / Miki, K.
履歴
登録
2004年7月8日
登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ
改定 1.0
2004年9月14日
Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1
2008年4月30日
Group: Version format compliance
改定 1.2
2011年7月13日
Group: Source and taxonomy / Version format compliance
タイプ: ADSC QUAMTUM 4r / 検出器: CCD / 日付: 2000年10月29日 / 詳細: bent plane mirror of fused quartz
放射
モノクロメーター: silicon (1 1 1) / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 1 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 1.5→100 Å / Num. obs: 63023 / % possible obs: 96 % / 冗長度: 4.063 % / Rmerge(I) obs: 0.061 / Net I/σ(I): 15.712
反射 シェル
解像度: 1.5→1.53 Å / Rmerge(I) obs: 0.277 / Mean I/σ(I) obs: 3.041 / % possible all: 59.2
-
解析
ソフトウェア
名称
分類
SHELX
モデル構築
SHELXL-97
精密化
HKL-2000
データ削減
SCALEPACK
データスケーリング
MLPHARE
位相決定
精密化
構造決定の手法: 多重同系置換 / 解像度: 1.5→26 Å / Num. parameters: 31201 / Num. restraintsaints: 39646 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / 立体化学のターゲット値: Engh & Huber 詳細: Water molecules from HOH 2208 to 2211 are related to multi-conformational ASN A 1.
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.1658
3024
-
RANDOM
obs
0.126
58414
90.7 %
-
all
-
62968
-
-
Refine analyze
Num. disordered residues: 17 / Occupancy sum hydrogen: 0 / Occupancy sum non hydrogen: 3375.4