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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1wdc | ||||||
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タイトル | SCALLOP MYOSIN REGULATORY DOMAIN | ||||||
![]() | (SCALLOP MYOSIN) x 3 | ||||||
![]() | MUSCLE PROTEIN / MYOSIN / CALCIUM BINDING PROTEIN | ||||||
機能・相同性 | ![]() cytoskeletal motor regulator activity / mitotic actomyosin contractile ring / mitotic actomyosin contractile ring contraction / muscle myosin complex / myosin filament / actomyosin structure organization / myosin II complex / locomotion / sarcomere organization / microfilament motor activity ...cytoskeletal motor regulator activity / mitotic actomyosin contractile ring / mitotic actomyosin contractile ring contraction / muscle myosin complex / myosin filament / actomyosin structure organization / myosin II complex / locomotion / sarcomere organization / microfilament motor activity / myofibril / myosin heavy chain binding / mitotic cytokinesis / muscle contraction / post-embryonic development / actin filament binding / calmodulin binding / calcium ion binding / ATP binding / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Houdusse, A. / Cohen, C. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structure of the regulatory domain of scallop myosin at 2 A resolution: implications for regulation. 著者: Houdusse, A. / Cohen, C. #1: ![]() タイトル: Structure of the Regulatory Domain of Scallop Myosin at 2.8 A Resolution 著者: Xie, X. / Harrison, D.H. / Schlichting, I. / Sweet, R.M. / Kalabokis, V.N. / Szent-Gyorgyi, A.G. / Cohen, C. #2: ![]() タイトル: Isolation of the Regulatory Domain of Scallop Myosin: Role of the Essential Light Chain in Calcium Binding 著者: Kwon, H. / Goodwin, E.B. / Nyitray, L. / Berliner, E. / O'Neall-Hennessey, E. / Melandri, F.D. / Szent-Gyorgyi, A.G. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 90 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 67 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
-タンパク質 , 3種, 3分子 ABC
#1: タンパク質 | 分子量: 7997.623 Da / 分子数: 1 / 断片: PROTEOLYTIC FRAGMENT, REGULATORY DOMAIN / 由来タイプ: 天然 / 詳細: PH 7.0 / 由来: (天然) ![]() |
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#2: タンパク質 | 分子量: 17560.855 Da / 分子数: 1 / 断片: PROTEOLYTIC FRAGMENT, REGULATORY DOMAIN / 由来タイプ: 天然 / 詳細: PH 7.0 / 由来: (天然) ![]() |
#3: タンパク質 | 分子量: 17635.635 Da / 分子数: 1 / 断片: PROTEOLYTIC FRAGMENT, REGULATORY DOMAIN / 由来タイプ: 天然 / 詳細: PH 7.0 / 由来: (天然) ![]() |
-非ポリマー , 3種, 166分子 ![](data/chem/img/MG.gif)
![](data/chem/img/CA.gif)
![](data/chem/img/HOH.gif)
![](data/chem/img/CA.gif)
![](data/chem/img/HOH.gif)
#4: 化合物 | ChemComp-MG / |
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#5: 化合物 | ChemComp-CA / |
#6: 水 | ChemComp-HOH / |
-詳細
構成要素の詳細 | THE RD FRAGMENT IS A TERNARY COMPLEX OF A PORTION OF HEAVY CHAIN WITH TWO LIGHT CHAINS. CHAIN LABEL ...THE RD FRAGMENT IS A TERNARY COMPLEX OF A PORTION OF HEAVY CHAIN WITH TWO LIGHT CHAINS. CHAIN LABEL A DESIGNATES |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.68 Å3/Da / 溶媒含有率: 51.9 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | pH: 7 / 詳細: pH 7.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 温度: 4 ℃ / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / 詳細: Xie, X., (1994) Nature, 368, 306. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 277 K |
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放射光源 | 波長: 1.5418 |
検出器 | タイプ: RIGAKU / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1993年10月1日 |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.02→100 Å / Num. obs: 26715 / % possible obs: 89.2 % / Rmerge(I) obs: 0.061 |
反射 | *PLUS Num. obs: 26725 / Num. measured all: 104023 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2→8 Å / σ(F): 2 詳細: SIDE CHAIN ATOMS OF RESIDUE GLU B 153 ARE NOT SEEN IN THE ELECTRON DENSITY.
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原子変位パラメータ | Biso mean: 36.52 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Refine analyze | Luzzati coordinate error obs: 0.2 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2→8 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS タイプ: x_dihedral_angle_d / Dev ideal: 24.135 |