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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1vze | ||||||
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タイトル | L. CASEI THYMIDYLATE SYNTHASE MUTANT E60Q TERNARY COMPLEX WITH DUMP AND CB3717 | ||||||
![]() | THYMIDYLATE SYNTHASE | ||||||
![]() | METHYLTRANSFERASE / NUCLEOTIDE SYNTHASE | ||||||
機能・相同性 | ![]() thymidylate synthase / thymidylate synthase activity / dTMP biosynthetic process / dTTP biosynthetic process / methylation / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Birdsall, D.L. / Finer-Moore, J. / Stroud, R.M. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: The separate effects of E60Q in Lactobacillus casei thymidylate synthase delineate between mechanisms for formation of intermediates in catalysis. 著者: Birdsall, D.L. / Huang, W. / Santi, D.V. / Stroud, R.M. / Finer-Moore, J. #1: ![]() タイトル: Refined Structures of Substrate-Bound and Phosphate-Bound Thymidylate Synthase from Lactobacillus Casei 著者: Finer-Moore, J. / Fauman, E.B. / Foster, P.G. / Perry, K.M. / Santi, D.V. / Stroud, R.M. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 100.2 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 82 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 968.3 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 1000.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 19.1 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 27.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 36585.461 Da / 分子数: 1 / 変異: E60Q / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 遺伝子: THYMIDYLATE SYNTHASE / プラスミド: PSCTS13 / 遺伝子 (発現宿主): THYMIDYLATE SYNTHASE / 発現宿主: ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-UMP / |
#3: 化合物 | ChemComp-CB3 / |
#4: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.83 Å3/Da / 溶媒含有率: 56.56 % | ||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 6.8 / 手法: 蒸気拡散法 | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射光源 | 波長: 1.5418 |
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検出器 | タイプ: RIGAKU RAXIS IIC / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1994年10月13日 |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | Num. obs: 12632 / % possible obs: 54.8 % / Observed criterion σ(I): 1 / Rmerge(I) obs: 0.0752 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.3 Å / 最低解像度: 15 Å |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.3→15 Å / σ(F): 1 /
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原子変位パラメータ | Biso mean: 16.4 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.3→15 Å
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拘束条件 |
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Xplor file |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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