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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1vt5 | ||||||||||||||||||
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タイトル | THE CRYSTAL STRUCTURE OF D(CCCCGGGG): A NEW A-FORM VARIANT WITH AN EXTENDED BACKBONE CONFORMATION | ||||||||||||||||||
![]() | DNA (5'-D(*![]() DNA / A-DNA / DOUBLE HELIX | 機能・相同性 | DNA | ![]() 手法 | ![]() ![]() Haran, T.E. / Shakked, Z. / Wang, A.H.-J. / Rich, A. | ![]() ![]() タイトル: The crystal structure of d(CCCCGGGG): a new A-form variant with an extended backbone conformation. 著者: Haran, T.E. / Shakked, Z. / Wang, A.H. / Rich, A. #1: ![]() タイトル: Molecular structure of the octamer d(G-G-C-C-G-G-C-C): modified A-DNA. 著者: Wang, A.H. / Fujii, S. / van Boom, J.H. / Rich, A. 履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 11.2 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 6.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 310.9 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 310.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 1.1 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 1.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: DNA鎖 | 分子量: 2428.593 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 詳細: SYNTHESIZED DNA |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.4 Å3/Da / 溶媒含有率: 48.81 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | pH: 7 / 詳細: MPD, Sodium Cacodylate, spermine, MgCl2, pH 7.00 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 |
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-データ収集
回折 |
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放射光源 |
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検出器 |
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放射 |
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放射波長 |
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反射 | 最高解像度: 2.25 Å |
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解析
ソフトウェア | 名称: CORELS / 分類: 精密化 | ||||||||||||
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精密化 | 解像度: 2.25→8 Å 詳細: REFERENCE 2 REPORTED A CELL OF 42.10, 42.10, 25.10 WITH SPACE GROUP OF P 43 21 2. THIS HAS SINCE BEEN CHANGED TO THE PRESENT CELL.
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Refine Biso | クラス: ALL ATOMS / 詳細: TR / Treatment: isotropic | ||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.25→8 Å
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