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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1vl6 | ||||||
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タイトル | Crystal structure of NAD-dependent malic enzyme (TM0542) from Thermotoga maritima at 2.61 A resolution | ||||||
要素 | malate oxidoreductase | ||||||
キーワード | OXIDOREDUCTASE (酸化還元酵素) / TM0542 / NAD-DEPENDENT MALIC ENZYME / STRUCTURAL GENOMICS (構造ゲノミクス) / JCSG / PROTEIN STRUCTURE INITIATIVE / PSI / Joint Center for Structural Genomics | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 malic enzyme activity / oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor / NAD binding / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Thermotoga maritima (テルモトガ・マリティマ) | ||||||
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 多波長異常分散 / 解像度: 2.61 Å | ||||||
データ登録者 | Joint Center for Structural Genomics (JCSG) | ||||||
引用 | ジャーナル: To be published タイトル: Crystal structure of NAD-dependent malic enzyme (TM0542) from Thermotoga maritima at 2.61 A resolution 著者: Joint Center for Structural Genomics (JCSG) | ||||||
履歴 |
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Remark 999 | SEQUENCE FOR THE VAL/MET CONFLICT AT RESIDUE 1: THIS GENE PRODUCT WAS EXPRESSED AS A FUSION ... SEQUENCE FOR THE VAL/MET CONFLICT AT RESIDUE 1: THIS GENE PRODUCT WAS EXPRESSED AS A FUSION PROTEIN, SO THE ORIGINAL INITIATION CODON WAS TRANSLATED AS VAL INSTEAD OF MET. THERE IS A POINT MUTATION, ILE TO VAL, AT POSITION 6. IT WAS AN ERROR INTRODUCED DURING CLONING. THIS IS SUPPORTED BY THE ELECTRON DENSITY WHICH CLEARLY SHOW VAL RESIDUES AT THE POSITION 6 OF ALL FOUR CHAINS. |
-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1vl6.cif.gz | 280.8 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1vl6.ent.gz | 230.8 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1vl6.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/vl/1vl6 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/vl/1vl6 | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
類似構造データ | |
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その他のデータベース |
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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単位格子 |
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非結晶学的対称性 (NCS) | NCSドメイン:
NCSドメイン領域: Component-ID: 1 / Refine code: 3
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