解像度: 1.62→60.72 Å / Num. obs: 20981 / % possible obs: 99.4 % / 冗長度: 7.7 % / Biso Wilson estimate: 25.41 Å2 / Rsym value: 0.059 / Net I/σ(I): 19.3
反射 シェル
解像度: 1.62→1.66 Å / 冗長度: 7.9 % / Mean I/σ(I) obs: 3.7 / Num. unique all: 1498 / Rsym value: 0.562 / % possible all: 98.6
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
MOSFLM
データ削減
SCALA
4.2)
データスケーリング
SOLVE
位相決定
RESOLVE
モデル構築
REFMAC
5.2.0000
精密化
CCP4
(SCALA)
データスケーリング
RESOLVE
位相決定
精密化
構造決定の手法: 多波長異常分散 / 解像度: 1.62→46.94 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.972 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.967 / SU B: 2.609 / SU ML: 0.047 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.079 / ESU R Free: 0.076 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD WITH PHASES 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.16673
1077
5.1 %
RANDOM
Rwork
0.14488
-
-
-
obs
0.146
19865
99.15 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK
原子変位パラメータ
Biso mean: 17.787 Å2
Baniso -1
Baniso -2
Baniso -3
1-
0.24 Å2
0 Å2
0 Å2
2-
-
0.24 Å2
0 Å2
3-
-
-
-0.49 Å2
精密化ステップ
サイクル: LAST / 解像度: 1.62→46.94 Å
タンパク質
核酸
リガンド
溶媒
全体
原子数
1270
0
13
172
1455
拘束条件
Refine-ID
タイプ
Dev ideal
Dev ideal target
数
X-RAY DIFFRACTION
r_bond_refined_d
0.015
0.022
1350
X-RAY DIFFRACTION
r_bond_other_d
0.001
0.02
1282
X-RAY DIFFRACTION
r_angle_refined_deg
1.568
1.956
1828
X-RAY DIFFRACTION
r_angle_other_deg
0.819
3
2977
X-RAY DIFFRACTION
r_dihedral_angle_1_deg
6.329
5
168
X-RAY DIFFRACTION
r_dihedral_angle_2_deg
35.746
24.31
58
X-RAY DIFFRACTION
r_dihedral_angle_3_deg
12.469
15
236
X-RAY DIFFRACTION
r_dihedral_angle_4_deg
15.666
15
7
X-RAY DIFFRACTION
r_chiral_restr
0.097
0.2
214
X-RAY DIFFRACTION
r_gen_planes_refined
0.007
0.02
1473
X-RAY DIFFRACTION
r_gen_planes_other
0.001
0.02
261
X-RAY DIFFRACTION
r_nbd_refined
0.218
0.2
240
X-RAY DIFFRACTION
r_nbd_other
0.172
0.2
1233
X-RAY DIFFRACTION
r_nbtor_other
0.084
0.2
807
X-RAY DIFFRACTION
r_xyhbond_nbd_refined
0.15
0.2
118
X-RAY DIFFRACTION
r_symmetry_vdw_refined
0.165
0.2
15
X-RAY DIFFRACTION
r_symmetry_vdw_other
0.22
0.2
46
X-RAY DIFFRACTION
r_symmetry_hbond_refined
0.141
0.2
22
X-RAY DIFFRACTION
r_mcbond_it
2.375
3
900
X-RAY DIFFRACTION
r_mcbond_other
0.541
3
344
X-RAY DIFFRACTION
r_mcangle_it
2.678
5
1362
X-RAY DIFFRACTION
r_scbond_it
4.431
8
541
X-RAY DIFFRACTION
r_scangle_it
5.989
11
465
LS精密化 シェル
解像度: 1.62→1.662 Å / Total num. of bins used: 20
Rfactor
反射数
%反射
Rfree
0.249
71
4.75 %
Rwork
0.185
1424
-
精密化 TLS
手法: refined / Origin x: 11.916 Å / Origin y: 9.972 Å / Origin z: 79.249 Å