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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1uxd | ||||||
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タイトル | Fructose repressor DNA-binding domain, NMR, 34 structures | ||||||
![]() | FRUCTOSE REPRESSOR | ||||||
![]() | TRANSCRIPTION REGULATION / DNA-BINDING PROTEIN / FRUCTOSE REPRESSOR / LACI FAMILY | ||||||
機能・相同性 | ![]() response to fructose / regulation of DNA-templated transcription initiation / cis-regulatory region sequence-specific DNA binding / transcription cis-regulatory region binding / DNA-binding transcription factor activity / regulation of DNA-templated transcription / identical protein binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / DISTANCE GEOMETRY SIMULATED ANNEALING | ||||||
![]() | Penin, F. / Geourjon, C. / Montserret, R. / Bockmann, A. / Lesage, A. / Yang, Y. / Bonod-Bidaud, C. / Cortay, J.C. / Negre, D. / Cozzone, A.J. / Deleage, G. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Three-dimensional structure of the DNA-binding domain of the fructose repressor from Escherichia coli by 1H and 15N NMR. 著者: Penin, F. / Geourjon, C. / Montserret, R. / Bockmann, A. / Lesage, A. / Yang, Y.S. / Bonod-Bidaud, C. / Cortay, J.C. / Negre, D. / Cozzone, A.J. / Deleage, G. #1: ![]() タイトル: Rapid Estimation of Relative Amide Proton Exchange Rates of 15 N-Labelled Proteins by a Straightforward Water Selective Noesy-Hsqc Experiment 著者: Bockmann, A. / Penin, F. / Guittet, E. #2: ![]() タイトル: Overproduction, Purification and Structural Characterization of the Functional N-Terminal DNA-Binding Domain of the Fru Repressor from Escherichia Coli K-12 著者: Scarabel, M. / Penin, F. / Bonod-Bidaud, C. / Negre, D. / Cozzone, A.J. / Cortay, J.C. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 620.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 520.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 355.8 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 599.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 38.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 64.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 7396.483 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() 解説: OVERPRODUCED IN FUSION WITH A LQHHHHHH SEQUENCE IN C-TERMINAL END (RESIDUES 58 TO 65) Variant: K12 / プラスミド: PCB4 / 遺伝子 (発現宿主): FRUR1 / 発現宿主: ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
試料状態 | pH: 5.9 / 温度: 293 K |
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結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Varian UNITYPLUS / 製造業者: Varian / モデル: UNITYPLUS / 磁場強度: 500 MHz |
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解析
ソフトウェア |
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NMR software |
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精密化 | 手法: DISTANCE GEOMETRY SIMULATED ANNEALING / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: RMSD AND ENERGY / 計算したコンフォーマーの数: 50 / 登録したコンフォーマーの数: 34 |