登録情報 | データベース: PDB / ID: 1u22 |
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タイトル | A. thaliana cobalamine independent methionine synthase |
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要素 | 5-methyltetrahydropteroyltriglutamate--homocysteine methyltransferase |
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キーワード | TRANSFERASE / METHIONINE / SYNTHASE / HOMOCYSTEINE / METHYLTETRAHYDROFOLATE |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-homocysteine S-methyltransferase / 5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-homocysteine S-methyltransferase activity / methionine synthase activity / 'de novo' L-methionine biosynthetic process / plasmodesma / methionine biosynthetic process / plant-type vacuole / apoplast / DNA methylation-dependent heterochromatin formation / chloroplast stroma ...5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-homocysteine S-methyltransferase / 5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-homocysteine S-methyltransferase activity / methionine synthase activity / 'de novo' L-methionine biosynthetic process / plasmodesma / methionine biosynthetic process / plant-type vacuole / apoplast / DNA methylation-dependent heterochromatin formation / chloroplast stroma / response to zinc ion / chloroplast / peroxisome / methylation / copper ion binding / mRNA binding / zinc ion binding / plasma membrane / cytosol類似検索 - 分子機能 Cobalamin-independent methionine synthase / Cobalamin-independent methionine synthase MetE, N-terminal / Cobalamin-independent synthase, N-terminal domain / Cobalamin-independent methionine synthase MetE, C-terminal/archaeal / Cobalamin-independent synthase, Catalytic domain / TIM Barrel - #210 / UROD/MetE-like superfamily / TIM Barrel / Alpha-Beta Barrel / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 2-AMINO-4-MERCAPTO-BUTYRIC ACID / (6S)-5,6,7,8-TETRAHYDROFOLATE / 5-methyltetrahydropteroyltriglutamate--homocysteine methyltransferase 1類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_plant.gif) Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / フーリエ合成 / 解像度: 2.65 Å |
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データ登録者 | Ferrer, J.-L. / Ravanel, S. / Robert, M. / Dumas, R. |
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引用 | ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2004 タイトル: Crystal structures of cobalamin-independent methionine synthase complexed with zinc, homocysteine, and methyltetrahydrofolate 著者: Ferrer, J.-L. / Ravanel, S. / Robert, M. / Dumas, R. |
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履歴 | 登録 | 2004年7月16日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2004年9月7日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2007年10月16日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.3 | 2023年8月23日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn / struct_conn_type / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.conn_type_id / _struct_conn.id / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_conn_type.id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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改定 1.4 | 2023年11月15日 | Group: Data collection / カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / Item: _chem_comp_atom.atom_id / _chem_comp_bond.atom_id_2 |
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改定 1.5 | 2024年4月3日 | Group: Structure summary / カテゴリ: chem_comp / Item: _chem_comp.pdbx_synonyms |
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