登録情報 | データベース: PDB / ID: 1u0l |
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タイトル | Crystal structure of YjeQ from Thermotoga maritima |
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要素 | Probable GTPase engC |
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キーワード | HYDROLASE / GTPase / permutation / OB-fold / Zinc-finger / Structural Genomics / BSGC structure funded by NIH / Protein Structure Initiative / PSI / Berkeley Structural Genomics Center |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
加水分解酵素; 酸無水物に作用; リン含有酸無水物に作用 / ribosomal small subunit biogenesis / rRNA binding / GTPase activity / GTP binding / metal ion binding / cytoplasm類似検索 - 分子機能 Ribosome biogenesis GTPase RsgA, N-terminal / RsgA N-terminal domain / Probable gtpase engc; domain 3 / Ribosome biogenesis GTPase RsgA / RsgA GTPase domain / RsgA GTPase / EngC GTPase domain profile. / Ribonucleotide Reductase Protein R1; domain 1 / Circularly permuted (CP)-type guanine nucleotide-binding (G) domain / Circularly permuted (CP)-type guanine nucleotide-binding (G) domain profile. ...Ribosome biogenesis GTPase RsgA, N-terminal / RsgA N-terminal domain / Probable gtpase engc; domain 3 / Ribosome biogenesis GTPase RsgA / RsgA GTPase domain / RsgA GTPase / EngC GTPase domain profile. / Ribonucleotide Reductase Protein R1; domain 1 / Circularly permuted (CP)-type guanine nucleotide-binding (G) domain / Circularly permuted (CP)-type guanine nucleotide-binding (G) domain profile. / Nucleic acid-binding proteins / OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) / P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases / Nucleic acid-binding, OB-fold / Beta Barrel / P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase / Rossmann fold / Orthogonal Bundle / 3-Layer(aba) Sandwich / Mainly Beta / Mainly Alpha / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE / Small ribosomal subunit biogenesis GTPase RsgA類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Thermotoga maritima (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 単波長異常分散 / 解像度: 2.8 Å |
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データ登録者 | Shin, D.H. / Lou, Y. / Jaru, J. / Kim, R. / Yokota, H. / Kim, S.H. / Berkeley Structural Genomics Center (BSGC) |
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引用 | ジャーナル: Proc.Natl.Acad.Sci.Usa / 年: 2004 タイトル: Crystal structure of YjeQ from Thermotoga maritima contains a circularly permuted GTPase domain 著者: Shin, D.H. / Lou, Y. / Jancarik, J. / Yokota, H. / Kim, R. / Kim, S.H. |
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履歴 | 登録 | 2004年7月13日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2004年9月7日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2008年4月30日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.3 | 2024年2月14日 | Group: Data collection / Database references / Derived calculations カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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