登録情報 | データベース: PDB / ID: 1u0b |
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タイトル | Crystal structure of cysteinyl-tRNA synthetase binary complex with tRNACys |
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要素 | - Cysteine--tRNA ligase
- cysteinyl tRNA
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キーワード | LIGASE/RNA / protein-RNA complex / LIGASE-RNA complex |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
cysteine-tRNA ligase / cysteine-tRNA ligase activity / cysteinyl-tRNA aminoacylation / aminoacyl-tRNA ligase activity / ligase activity / zinc ion binding / ATP binding / metal ion binding / cytoplasm / cytosol類似検索 - 分子機能 Cysteinyl-tRNA synthetase, class Ia, DALR / DALR domain / DALR_2 / Cysteine-tRNA ligase / Cysteinyl-tRNA synthetase/mycothiol ligase / tRNA synthetases class I, catalytic domain / tRNA synthetases class I (C) catalytic domain / Aminoacyl-tRNA synthetase, class Ia, anticodon-binding / HUPs / Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold ...Cysteinyl-tRNA synthetase, class Ia, DALR / DALR domain / DALR_2 / Cysteine-tRNA ligase / Cysteinyl-tRNA synthetase/mycothiol ligase / tRNA synthetases class I, catalytic domain / tRNA synthetases class I (C) catalytic domain / Aminoacyl-tRNA synthetase, class Ia, anticodon-binding / HUPs / Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold / Rossmann fold / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 : / RNA / RNA (> 10) / Cysteine--tRNA ligase / Cysteine--tRNA ligase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Escherichia coli (大腸菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.3 Å |
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データ登録者 | Hauenstein, S. / Zhang, C.M. / Hou, Y.M. / Perona, J.J. |
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引用 | ジャーナル: Nat.Struct.Mol.Biol. / 年: 2004 タイトル: Shape-selective RNA recognition by cysteinyl-tRNA synthetase 著者: Hauenstein, S. / Zhang, C.M. / Hou, Y.M. / Perona, J.J. |
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履歴 | 登録 | 2004年7月13日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2004年11月23日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2008年4月30日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.3 | 2023年8月23日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description / Source and taxonomy / Structure summary カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / entity / entity_name_com / entity_src_gen / pdbx_entity_src_syn / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_keywords / struct_ref / struct_ref_seq / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _entity.details / _entity.pdbx_description / _entity.pdbx_ec / _entity.src_method / _entity_src_gen.entity_id / _entity_src_gen.gene_src_genus / _entity_src_gen.host_org_genus / _entity_src_gen.pdbx_beg_seq_num / _entity_src_gen.pdbx_description / _entity_src_gen.pdbx_end_seq_num / _entity_src_gen.pdbx_seq_type / _pdbx_entity_src_syn.details / _pdbx_entity_src_syn.entity_id / _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id / _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific / _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num / _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_keywords.pdbx_keywords / _struct_keywords.text / _struct_ref.db_code / _struct_ref.db_name / _struct_ref.entity_id / _struct_ref.pdbx_align_begin / _struct_ref.pdbx_db_accession / _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code / _struct_ref_seq.db_align_beg / _struct_ref_seq.db_align_end / _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end / _struct_ref_seq.pdbx_db_accession / _struct_ref_seq.pdbx_strand_id / _struct_ref_seq.seq_align_end / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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