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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1tfp | ||||||
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タイトル | TRANSTHYRETIN (FORMERLY KNOWN AS PREALBUMIN) | ||||||
![]() | TRANSTHYRETIN | ||||||
![]() | TRANSPORT (THYROXINE) / ALBUMIN / RETINOL-BINDING | ||||||
機能・相同性 | ![]() oocyte growth / yolk / thyroid hormone transport / hormone binding / retinol metabolic process / clathrin-coated vesicle / thyroid hormone binding / purine nucleobase metabolic process / small molecule binding / protein tetramerization ...oocyte growth / yolk / thyroid hormone transport / hormone binding / retinol metabolic process / clathrin-coated vesicle / thyroid hormone binding / purine nucleobase metabolic process / small molecule binding / protein tetramerization / response to virus / hormone activity / protein-containing complex assembly / protein heterodimerization activity / protein domain specific binding / protein-containing complex / extracellular space 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Sunde, M. / Richardson, S.J. / Chang, L. / Pettersson, T.M. / Schreiber, G. / Blake, C.C.F. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: The crystal structure of transthyretin from chicken. 著者: Sunde, M. / Richardson, S.J. / Chang, L. / Pettersson, T.M. / Schreiber, G. / Blake, C.C. #1: ![]() タイトル: Structure of Prealbumin: Secondary, Tertiary and Quaternary Interactions Determined by Fourier Refinement at 1.8 A 著者: Blake, C.C. / Geisow, M.J. / Oatley, S.J. / Rerat, B. / Rerat, C. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 55.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 40.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 430.6 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 435 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 10.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 13.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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2 | ![]()
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単位格子 |
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非結晶学的対称性 (NCS) | NCS oper: (Code: given Matrix: (-0.6091, -0.6784, -0.4108), ベクター: |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 14175.711 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) ![]() ![]() #2: 化合物 | ChemComp-SO4 / | #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.47 Å3/Da / 溶媒含有率: 62 % | ||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 温度: 20 ℃ / pH: 7 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 292 K |
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放射光源 | 波長: 1.5418 |
検出器 | タイプ: MARRESEARCH / 検出器: IMAGE PLATE |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.8→100 Å / Num. obs: 10781 / % possible obs: 78 % / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 2.3 % / Rmerge(I) obs: 0.083 |
反射 | *PLUS Num. measured all: 22739 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.9→8 Å / σ(F): 0 /
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原子変位パラメータ | Biso mean: 52.6 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.9→8 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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