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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1t8v | ||||||
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タイトル | The NMR structure of d34a i-fabp: implications for the determinants of ligand binding stoichiometry | ||||||
![]() | Fatty acid-binding protein, intestinal | ||||||
![]() | LIPID BINDING PROTEIN / fatty acid / stoichiometry | ||||||
機能・相同性 | ![]() Triglyceride catabolism / intestinal lipid absorption / apical cortex / intestinal absorption / long-chain fatty acid transmembrane transporter activity / long-chain fatty acid binding / microvillus / fatty acid transport / long-chain fatty acid transport / fatty acid metabolic process ...Triglyceride catabolism / intestinal lipid absorption / apical cortex / intestinal absorption / long-chain fatty acid transmembrane transporter activity / long-chain fatty acid binding / microvillus / fatty acid transport / long-chain fatty acid transport / fatty acid metabolic process / fatty acid binding / nucleus / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / distance geometry, simulated annealing, molecular dynamics, torsion angle dynamics | ||||||
![]() | Ogbay, B. / Cistola, D.P. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: THE NMR STRUCTURE OF D34A I-FABP: IMPLICATIONS FOR THE DETERMINANTS OF LIGAND BINDING STOICHIOMETRY 著者: Ogbay, B. / Cistola, D.P. #1: ![]() タイトル: The NMR structure of a stable and compact all-B-sheet variant of intestinal fatty acid-binding protein 著者: Cistola, D.P. / Ogbay, B. / Dekoster, G.T. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 389.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 319.1 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 355.3 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 587.6 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 79.1 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 108.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 14971.005 Da / 分子数: 1 / 変異: D34A / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: The structure was determined using triple-resonance NMR spectroscopy. |
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試料調製
詳細 | 内容: 20 mM potassium phosphate, 50 mM KCl, 0.5% NaN3, 95% H2O, 5% D2O 溶媒系: 95% H2O/5% D2O |
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試料状態 | イオン強度: 50mM KCl / pH: 7.2 / 温度: 298 K |
-NMR測定
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M | |||||||||||||||
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放射波長 | 相対比: 1 | |||||||||||||||
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: distance geometry, simulated annealing, molecular dynamics, torsion angle dynamics ソフトェア番号: 1 詳細: the structures are based on a total of 3471 NOE-derived restraints and 80 dihedral angle restraints. | ||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 20 / 登録したコンフォーマーの数: 10 |