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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1sro | ||||||
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タイトル | S1 RNA BINDING DOMAIN, NMR, 20 STRUCTURES | ||||||
要素 | PNPASE | ||||||
キーワード | S1 RNA-BINDING DOMAIN / POLYNUCLEOTIDE PHOSPHORYLASE (PNPASE) | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 polyribonucleotide nucleotidyltransferase / polyribonucleotide nucleotidyltransferase activity / bacterial degradosome / cyclic-di-GMP binding / RNA catabolic process / mRNA catabolic process / RNA processing / 3'-5'-RNA exonuclease activity / response to heat / magnesium ion binding ...polyribonucleotide nucleotidyltransferase / polyribonucleotide nucleotidyltransferase activity / bacterial degradosome / cyclic-di-GMP binding / RNA catabolic process / mRNA catabolic process / RNA processing / 3'-5'-RNA exonuclease activity / response to heat / magnesium ion binding / RNA binding / identical protein binding / membrane / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Escherichia coli (大腸菌) | ||||||
手法 | 溶液NMR | ||||||
データ登録者 | Bycroft, M. | ||||||
引用 | ジャーナル: Cell(Cambridge,Mass.) / 年: 1997 タイトル: The solution structure of the S1 RNA binding domain: a member of an ancient nucleic acid-binding fold. 著者: Bycroft, M. / Hubbard, T.J. / Proctor, M. / Freund, S.M. / Murzin, A.G. #1: ジャーナル: Gene / 年: 1992 タイトル: Translational Initiation Factors If-1 and Eif-2 Alpha Share an RNA-Binding Motif with Prokaryotic Ribosomal Protein S1 and Polynucleotide Phosphorylase 著者: Gribskov, M. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1sro.cif.gz | 468.6 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1sro.ent.gz | 389.2 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1sro.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/sr/1sro ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/sr/1sro | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 8380.697 Da / 分子数: 1 / 断片: S1 RNA BINDING DOMAIN / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Escherichia coli (大腸菌) / プラスミド: PGET2T 遺伝子 (発現宿主): S1 RNA BINDING DOMAIN FROM ESCHERICHIA COLI PNPASE 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P05055 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR |
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-試料調製
結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
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-解析
ソフトウェア |
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NMR software | 名称: X-PLOR / バージョン: 3.1 / 開発者: BRUNGER / 分類: 精密化 | ||||||||||||
NMRアンサンブル | 登録したコンフォーマーの数: 20 |