登録情報 | データベース: PDB / ID: 1s4p |
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タイトル | Crystal structure of yeast alpha1,2-mannosyltransferase Kre2p/Mnt1p: ternary complex with GDP/Mn and methyl-alpha-mannoside acceptor |
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要素 | Glycolipid 2-alpha-mannosyltransferase |
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キーワード | TRANSFERASE / ALPHA/BETA FOLD / NUCLEOTIDE-BINDING DOMAIN / ROSSMANN FOLD / TERNARY COMPLEX WITH GDP-MN2+ AND METHYL-ALPHA-MANNOSIDE ACCEPTOR |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
alpha-1,2-mannosyltransferase activity / mannosylation / cell wall mannoprotein biosynthetic process / N-glycan processing / protein O-linked glycosylation / protein N-linked glycosylation / fungal-type vacuole membrane / 転移酵素; グリコシル基を移すもの; 六炭糖残基を移すもの / Golgi medial cisterna / Golgi membrane / Golgi apparatus類似検索 - 分子機能 Glycosyl transferase, family 15 / Glycolipid 2-alpha-mannosyltransferase / Spore Coat Polysaccharide Biosynthesis Protein SpsA; Chain A / Spore Coat Polysaccharide Biosynthesis Protein SpsA; Chain A / Nucleotide-diphospho-sugar transferases / Alpha-Beta Complex / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE / methyl alpha-D-mannopyranoside / : / Glycolipid 2-alpha-mannosyltransferase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_yeast.gif) Saccharomyces cerevisiae (パン酵母) |
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手法 | X線回折 / 分子置換 / 解像度: 2.01 Å |
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データ登録者 | Lobsanov, Y.D. / Romero, P.A. / Sleno, B. / Yu, B. / Yip, P. / Herscovics, A. / Howell, P.L. |
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引用 | ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2004 タイトル: Structure of Kre2p/Mnt1p: A YEAST {alpha}1,2-MANNOSYLTRANSFERASE INVOLVED IN MANNOPROTEIN BIOSYNTHESIS 著者: Lobsanov, Y.D. / Romero, P.A. / Sleno, B. / Yu, B. / Yip, P. / Herscovics, A. / Howell, P.L. |
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履歴 | 登録 | 2004年1月16日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2004年5月4日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2008年4月29日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Non-polymer description / Version format compliance |
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改定 2.0 | 2020年7月29日 | Group: Atomic model / Data collection ...Atomic model / Data collection / Database references / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: atom_site / chem_comp ...atom_site / chem_comp / entity / pdbx_branch_scheme / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_branch / pdbx_entity_branch_descriptor / pdbx_entity_branch_link / pdbx_entity_branch_list / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_struct_assembly_gen / pdbx_struct_conn_angle / struct_asym / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site / struct_site_gen Item: _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ..._atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_asym_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.label_entity_id / _atom_site.occupancy / _atom_site.type_symbol / _chem_comp.mon_nstd_flag / _chem_comp.name / _chem_comp.type / _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.pdbx_role / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation |
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改定 2.1 | 2023年8月23日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Refinement description / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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