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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1rxh | ||||||
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タイトル | Crystal structure of streptavidin mutant L124R (M1) complexed with biotinyl p-nitroanilide (BNI) | ||||||
![]() | Streptavidin | ||||||
![]() | UNKNOWN FUNCTION / avidin / streptavidin / pseudo enzymatic activity | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Eisenberg-Domovich, Y. / Pazy, Y. / Nir, O. / Raboy, B. / Bayer, E.A. / Wilchek, M. / Livnah, O. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structural elements responsible for conversion of streptavidin to a pseudoenzyme 著者: Eisenberg-Domovich, Y. / Pazy, Y. / Nir, O. / Raboy, B. / Bayer, E.A. / Wilchek, M. / Livnah, O. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 56.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 42.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 498.9 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 514.3 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 9.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 12.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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詳細 | Two monomers in the asymmetric unit starting at residues 13 and 213. The second part of the biological assembly is generated by the symmetry operation -y,-x,-z+1/6 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 13325.372 Da / 分子数: 2 / 変異: L124R, L324R / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() プラスミド: pET-21a / 発現宿主: ![]() ![]() #2: 化合物 | #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.05 Å3/Da / 溶媒含有率: 40.11 % |
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 110 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: RIGAKU RAXIS IV / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 2002年10月20日 / 詳細: Max Flux |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.54 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.9→40 Å / Num. obs: 5466 / % possible obs: 97.9 % / Observed criterion σ(F): 1 / Observed criterion σ(I): 1 |
反射 シェル | 解像度: 2.9→3 Å / % possible all: 98.3 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.9→40 Å
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