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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1rq8 | ||||||
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タイトル | Solution structure of the hypothetical protein SAV1595 from Staphylococcus aureus, a putative RNA binding protein | ||||||
![]() | conserved hypothetical protein | ||||||
![]() | STRUCTURAL GENOMICS / UNKNOWN FUNCTION / SAV1595 / YhbY / UPF0044 | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
![]() | Liu, D. / Wyss, D.F. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Solution Structure of the Hypothetical Protein SAV1595 from Staphylococcus Aureus, a Putative RNA Binding Protein. 著者: Liu, D. / Wyss, D.F. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 311.5 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 257.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 347.2 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 458.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 30.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 42 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 12167.879 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 詳細: homologous to YhbY of E.coli. 由来: (組換発現) ![]() ![]() 生物種 (発現宿主): Escherichia coli / 発現宿主: ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 | 内容: 1 mM SAV1595, U-15N,13C; 75 mM phosphate buffer, 8%D2O 溶媒系: 92%H2O, 8%D2O |
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試料状態 | イオン強度: 0.45 / pH: 7.5 / 圧: ambient / 温度: 298 K |
-NMR測定
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M |
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放射波長 | 相対比: 1 |
NMRスペクトロメーター | タイプ: Varian INOVA / 製造業者: Varian / モデル: INOVA / 磁場強度: 600 MHz |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the least restraint violations 計算したコンフォーマーの数: 50 / 登録したコンフォーマーの数: 10 |