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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1rob | ||||||
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タイトル | STRUCTURE OF THE CRYSTALLINE COMPLEX OF CYTIDYLIC ACID (2'-CMP) WITH RIBONUCLEASE AT 1.6 ANGSTROMS RESOLUTION | ||||||
![]() | RIBONUCLEASE A | ||||||
![]() | HYDROLASE(ENDORIBONUCLEASE) | ||||||
機能・相同性 | ![]() pancreatic ribonuclease / ribonuclease A activity / RNA nuclease activity / nucleic acid binding / defense response to Gram-positive bacterium / lyase activity / extracellular region 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Lisgarten, J.N. / Palmer, R.A. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structure of the crystalline complex of cytidylic acid (2'-CMP) with ribonuclease at 1.6 A resolution. Conservation of solvent sites in RNase-A high-resolution structures. 著者: Lisgarten, J.N. / Gupta, V. / Maes, D. / Wyns, L. / Zegers, I. / Palmer, R.A. / Dealwis, C.G. / Aguilar, C.F. / Hemmings, A.M. #1: ![]() タイトル: Newly Observed Binding Mode in Pancreatic Ribonuclease 著者: Aguilar, C.F. / Thomas, P.J. / Mills, A. / Moss, D.S. / Palmer, R.A. #2: ![]() タイトル: X-Ray Refinement Study on the Binding of Cytidylic Acid (2'-Cmp) to Ribonuclease A 著者: Howlin, B. / Harris, W. / Moss, D.S. / Palmer, R.A. #3: ![]() タイトル: The Refined Structure of Ribonuclease-A at 1.45 Angstroms Resolution 著者: Borkakoti, N. / Moss, D.S. / Stanford, M.J. / Palmer, R.A. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 37.7 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 25.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: CIS PROLINE - PRO 93 / 2: CIS PROLINE - PRO 114 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 13708.326 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-C2P / |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
Has protein modification | Y |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.18 Å3/Da / 溶媒含有率: 43.55 % |
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結晶化 | *PLUS 手法: unknown / PH range low: 5.7 / PH range high: 5.2 |
溶液の組成 | *PLUS 濃度: 30-40 % / 一般名: ethanol |
-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS Num. obs: 11945 / Num. measured all: 39576 |
反射 シェル | *PLUS 最高解像度: 1.54 Å / 最低解像度: 1.63 Å / % possible obs: 76 % / Rmerge(I) obs: 0.227 |
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解析
ソフトウェア | 名称: RESTRAIN / 分類: 精密化 | ||||||||||||
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精密化 | Rfactor obs: 0.17 / 最高解像度: 1.6 Å | ||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 1.6 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: RESTRAIN / 分類: refinement | ||||||||||||
精密化 | *PLUS 最高解像度: 1.6 Å / 最低解像度: 20 Å / Num. reflection obs: 11945 / Rfactor obs: 0.17 | ||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |