PDB-1rnk: THE STRUCTURE OF AN RNA PSEUDOKNOT THAT CAUSES EFFICIENT FRAMESHI...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 1rnk

タイトル

THE STRUCTURE OF AN RNA PSEUDOKNOT THAT CAUSES EFFICIENT FRAMESHIFTING IN MOUSE MAMMARY TUMOR VIRUS

要素

RNA PSEUDOKNOT

キーワード

RNA / MOUSE MAMMARY TUMOR VIRUS / PSEUDOKNOT

機能・相同性

RNA / RNA (> 10)

機能・相同性情報

手法

溶液NMR

データ登録者

Shen, L.X. / Tinoco Junior, I.

引用

ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1995
タイトル: The structure of an RNA pseudoknot that causes efficient frameshifting in mouse mammary tumor virus.
著者: Shen, L.X. / Tinoco Jr., I.

履歴

登録	1995年1月11日	処理サイト: BNL
改定 1.0	1995年2月27日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2008年3月24日	Group: Version format compliance
改定 1.2	2011年7月13日	Group: Version format compliance
改定 1.3	2022年3月2日	Group: Database references / Derived calculations / Other カテゴリ: database_2 / pdbx_database_status ...database_2 / pdbx_database_status / pdbx_struct_assembly / pdbx_struct_oper_list Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_database_status.process_site
改定 1.4	2024年5月22日	Group: Data collection / カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	1rnk.cif.gz	29 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb1rnk.ent.gz	19.8 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	1rnk.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

文書・要旨	1rnk_validation.pdf.gz	291 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	1rnk_full_validation.pdf.gz	290.8 KB	表示
XML形式データ	1rnk_validation.xml.gz	1.7 KB	表示
CIF形式データ	1rnk_validation.cif.gz	2 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/rn/1rnk ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/rn/1rnk	HTTPS FTP

-
関連構造データ

類似構造データ	1bn9-d 4kyy-d 1kp7-d 430d-d 1lwa-d 3a5t-3 1rb5-d 3k2a-d 1jrn-d 1kxs-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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類似性 (1)
#241 - 2020年1月
20年の分子を振り返って (Twenty Years of Molecules)
類似性 (1)

登録構造単位

A: RNA PSEUDOKNOT

11 kDa, 1 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者が定義した集合体

NMR アンサンブル

	データ	基準
コンフォーマー数 (登録 / 計算)	1 / -
代表モデル

#1: RNA鎖	RNA PSEUDOKNOT 分子量: 10967.613 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 詳細: CHEMICALLY SYNTHESIZED / キーワード: RIBONUCLEIC ACID

-
実験

実験	手法: 溶液NMR

-
解析

ソフトウェア

名称	分類
X-PLOR	モデル構築
X-PLOR	精密化
X-PLOR	位相決定

NMR software

名称:

X-PLOR / 開発者: BRUNGER / 分類: 精密化

精密化

ソフトェア番号: 1
詳細: NUMBER OF ATOMS USED IN REFINEMENT. NUMBER OF PROTEIN ATOMS 0 NUMBER OF NUCLEIC ACID ATOMS 726 NUMBER OF HETEROGEN ATOMS 0 NUMBER OF SOLVENT ATOMS 0

NMRアンサンブル

登録したコンフォーマーの数: 1

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