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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1rmj | ||||||
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タイトル | C-terminal domain of insulin-like growth factor (IGF) binding protein-6: structure and interaction with IGF-II | ||||||
![]() | Insulin-like growth factor binding protein 6 | ||||||
![]() | HORMONE/GROWTH FACTOR / Insulin-like growth factor binding protein / HORMONE-GROWTH FACTOR COMPLEX | ||||||
機能・相同性 | ![]() insulin-like growth factor binary complex / regulation of insulin-like growth factor receptor signaling pathway / positive regulation of stress-activated MAPK cascade / insulin-like growth factor II binding / insulin-like growth factor I binding / fibronectin binding / negative regulation of canonical Wnt signaling pathway / Regulation of Insulin-like Growth Factor (IGF) transport and uptake by Insulin-like Growth Factor Binding Proteins (IGFBPs) / cell migration / positive regulation of MAPK cascade ...insulin-like growth factor binary complex / regulation of insulin-like growth factor receptor signaling pathway / positive regulation of stress-activated MAPK cascade / insulin-like growth factor II binding / insulin-like growth factor I binding / fibronectin binding / negative regulation of canonical Wnt signaling pathway / Regulation of Insulin-like Growth Factor (IGF) transport and uptake by Insulin-like Growth Factor Binding Proteins (IGFBPs) / cell migration / positive regulation of MAPK cascade / negative regulation of cell population proliferation / signaling receptor binding / signal transduction / extracellular space / extracellular region / identical protein binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / distance geometry simulated annealing | ||||||
![]() | Headey, S.J. / Keizer, D.W. / Yao, S. / Brasier, G. / Kantharidis, P. / Bach, L.A. / Norton, R.S. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: C-terminal domain of insulin-like growth factor (IGF) binding protein-6: structure and interaction with IGF-II. 著者: Headey, S.J. / Keizer, D.W. / Yao, S. / Brasier, G. / Kantharidis, P. / Bach, L.A. / Norton, R.S. #1: ![]() タイトル: 1H, 13C and 15N resonance assignments of the C-terminal domain of insulin-like growth factor binding protein-6 (IGFBP-6). 著者: Headey, S.J. / Yao, S. / Parker, N.J. / Kantharidis, P. / Bach, L.A. / Norton, R.S. #2: ジャーナル: Febs Lett. / 年: 2004 タイトル: Binding site for the C-domain of insulin-like growth factor (IGF) binding protein-6 on IGF-II; implications for inhibition of IGF actions. 著者: Headey, S.J. / Keizer, D.W. / Yao, S. / Wallace, J.C. / Bach, L.A. / Norton, R.S. #3: ![]() タイトル: C-Terminal Domain of Insulin-like Growth Factor (IGF) Binding Protein 6: Conformational Exchange and Its Correlation with IGF-II Binding 著者: Yao, S. / Headey, S.J. / Keizer, D.W. / Bach, L.A. / Norton, R.S. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 631.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 546.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 362.6 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 525.6 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 44.9 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 72.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ | |
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その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 12076.315 Da / 分子数: 1 断片: C-terminal Domain, sequence database resiude 161-240 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: This structure was determined using standard 3D heteronuclear techniques. |
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試料調製
詳細 | 内容: 1 mM protein 10 mM sodium acetate 0.02 % sodium azide 溶媒系: 95% H2O/5% D2O |
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試料状態 | イオン強度: 10 mM sodium acetate / pH: 4.5 / 圧: ambient / 温度: 298 K |
-NMR測定
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M | ||||||||||||||||||||
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放射波長 | 相対比: 1 | ||||||||||||||||||||
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: distance geometry simulated annealing / ソフトェア番号: 1 詳細: The structures are based on a total of 1067 restraints, 912 are NOE-derived distance constraints, 145 dihedral angle restraints,10 distance restraints from hydrogen bonds. | |||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: closest to the average | |||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 50 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |