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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1rhd | ||||||
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タイトル | STRUCTURE OF BOVINE LIVER RHODANESE. I. STRUCTURE DETERMINATION AT 2.5 ANGSTROMS RESOLUTION AND A COMPARISON OF THE CONFORMATION AND SEQUENCE OF ITS TWO DOMAINS | ||||||
要素 | RHODANESEロダネーゼ | ||||||
キーワード | TRANSFERASE(THIOSULFATE / CYANIDE SULFUR) | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 rRNA transport / 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase activity / ロダネーゼ / thiosulfate sulfurtransferase activity / rRNA import into mitochondrion / 5S rRNA binding / ミトコンドリアマトリックス / ミトコンドリア 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Bos taurus (ウシ) | ||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 2.5 Å | ||||||
データ登録者 | Hol, W.G.J. / Ploegman, J.H. / Kalk, K.H. / Drent, G. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1978 タイトル: Structure of bovine liver rhodanese. I. Structure determination at 2.5 A resolution and a comparison of the conformation and sequence of its two domains. 著者: Ploegman, J.H. / Drent, G. / Kalk, K.H. / Hol, W.G. #1: ジャーナル: Biochemistry / 年: 1983 タイトル: Binding of Metal Cyanide Complexes to Bovine Liver Rhodanese in the Crystalline State 著者: Lijk, L.J. / Kalk, K.H. / Brandenburg, N.P. / Hol, W.G.J. #2: ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1979 タイトル: The Structure of Bovine Liver Rhodanese. II. The Active Site in the Sulfur-Substituted and the Sulfur-Free Enzyme 著者: Ploegman, J.H. / Drent, G. / Kalk, K.H. / Hol, W.G.J. #3: ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1975 タイトル: The Double Domain Structure of Rhodanese 著者: Bergsma, J. / Hol, W.G.J. / Jansonius, J.N. / Kalk, K.H. / Ploegman, J.H. / Smit, J.D.G. #4: ジャーナル: Thesis / 年: 1977 タイトル: The Three-Dimensional Structure of Bovine Liver Rhodanese 著者: Ploegman, J.H. #5: ジャーナル: Isr.J.Chem. / 年: 1974 タイトル: The Structure of Rhodanese at 4 Angstroms Resolution. The Conformation of the Polypeptide Chain 著者: Smit, J.D.G. / Ploegman, J.H. / Pierrot, M. / Kalk, K.H. / Jansonius, J.N. / Drenth, J. #7: ジャーナル: Biochem.Biophys.Res.Commun. / 年: 1971 タイトル: Crystallographic Data for Rhodanese from Bovine Liver 著者: Drenth, J. / Smit, J.D.G. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1rhd.cif.gz | 67.2 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1rhd.ent.gz | 46.6 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1rhd.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/rh/1rhd ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/rh/1rhd | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 32982.375 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Bos taurus (ウシ) / 参照: UniProt: P00586, ロダネーゼ |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.42 Å3/Da / 溶媒含有率: 49.18 % | |||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 7.3 / 手法: unknown | |||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
-解析
精密化 | 最高解像度: 2.5 Å | ||||||||||||
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 2.5 Å
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精密化 | *PLUS Num. reflection obs: 10102 | ||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |