登録情報 | データベース: PDB / ID: 1qi7 |
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タイトル | THE CRYSTAL STRUCTURE AT 2.0 A OF SAPORIN SO6, A RIBOSOME INACTIVATING PROTEIN FROM SAPONARIA OFFICINALIS |
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要素 | PROTEIN (N-GLYCOSIDASE) |
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キーワード | HYDROLASE / RIBOSOME INACTIVATING PROTEIN / N-GLYCOSIDASE |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
rRNA N-glycosylase / rRNA N-glycosylase activity / defense response / toxin activity / negative regulation of translation類似検索 - 分子機能 Ricin (A Subunit), domain 2 / Ricin (A Subunit), domain 2 / Ricin (A subunit); domain 1 / Ricin (A subunit), domain 1 / Ribosome-inactivating protein conserved site / Shiga/ricin ribosomal inactivating toxins active site signature. / Ribosome-inactivating protein type 1/2 / Ribosome-inactivating protein / Ribosome-inactivating protein, subdomain 1 / Ribosome-inactivating protein, subdomain 2 ...Ricin (A Subunit), domain 2 / Ricin (A Subunit), domain 2 / Ricin (A subunit); domain 1 / Ricin (A subunit), domain 1 / Ribosome-inactivating protein conserved site / Shiga/ricin ribosomal inactivating toxins active site signature. / Ribosome-inactivating protein type 1/2 / Ribosome-inactivating protein / Ribosome-inactivating protein, subdomain 1 / Ribosome-inactivating protein, subdomain 2 / Ribosome-inactivating protein superfamily / Ribosome inactivating protein / Few Secondary Structures / Irregular / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 Ribosome-inactivating protein saporin-6 / Ribosome-inactivating protein saporin-2類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Saponaria officinalis (シャボンソウ) |
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手法 | X線回折 / 分子置換 / 解像度: 2 Å |
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データ登録者 | Savino, C. / Federici, L. / Ippoliti, R. / Lendaro, E. / Tsernoglou, D. |
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引用 | ジャーナル: FEBS Lett. / 年: 2000 タイトル: The crystal structure of saporin SO6 from Saponaria officinalis and its interaction with the ribosome. 著者: Savino, C. / Federici, L. / Ippoliti, R. / Lendaro, E. / Tsernoglou, D. |
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履歴 | 登録 | 1999年6月8日 | 登録サイト: PDBE / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2000年6月5日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2008年4月26日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Derived calculations / Version format compliance |
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改定 1.3 | 2017年10月4日 | Group: Refinement description / カテゴリ: software |
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改定 1.4 | 2023年8月16日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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