解像度: 1.9→1.97 Å / 冗長度: 6.6 % / Rmerge(I) obs: 0.336 / Mean I/σ(I) obs: 5.07 / Num. unique all: 3191 / Rsym value: 0.336 / % possible all: 98.8
反射
*PLUS
最高解像度: 1.89 Å / 最低解像度: 25 Å
反射 シェル
*PLUS
最高解像度: 1.89 Å / 最低解像度: 1.95 Å / % possible obs: 98.8 %
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
MAR345
データ収集
SCALEPACK
データスケーリング
SOLVE
位相決定
RESOLVE
モデル構築
REFMAC
5.1.24
精密化
RESOLVE
位相決定
精密化
構造決定の手法: 多波長異常分散 開始モデル: built from MAD 解像度: 1.9→20 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.959 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.949 / SU B: 2.9 / SU ML: 0.086 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / σ(I): 0 / ESU R: 0.129 / ESU R Free: 0.123 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.22171
1654
5.1 %
RANDOM
Rwork
0.19147
-
-
-
all
0.191
32697
-
-
obs
0.19301
30975
99.28 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK
原子変位パラメータ
Biso mean: 32.419 Å2
Baniso -1
Baniso -2
Baniso -3
1-
-1.47 Å2
0 Å2
0 Å2
2-
-
3 Å2
0 Å2
3-
-
-
-1.53 Å2
精密化ステップ
サイクル: LAST / 解像度: 1.9→20 Å
タンパク質
核酸
リガンド
溶媒
全体
原子数
2302
0
7
214
2523
拘束条件
Refine-ID
タイプ
Dev ideal
Dev ideal target
数
X-RAY DIFFRACTION
r_bond_refined_d
0.02
0.021
2378
X-RAY DIFFRACTION
r_bond_other_d
0.002
0.02
2123
X-RAY DIFFRACTION
r_angle_refined_deg
1.903
1.956
3219
X-RAY DIFFRACTION
r_angle_other_deg
0.948
3
4972
X-RAY DIFFRACTION
r_dihedral_angle_1_deg
6.976
5
281
X-RAY DIFFRACTION
r_chiral_restr
0.116
0.2
350
X-RAY DIFFRACTION
r_gen_planes_refined
0.014
0.02
2589
X-RAY DIFFRACTION
r_gen_planes_other
0.019
0.02
485
X-RAY DIFFRACTION
r_nbd_refined
0.218
0.2
496
X-RAY DIFFRACTION
r_nbd_other
0.242
0.2
2409
X-RAY DIFFRACTION
r_nbtor_other
0.091
0.2
1364
X-RAY DIFFRACTION
r_xyhbond_nbd_refined
0.183
0.2
169
X-RAY DIFFRACTION
r_symmetry_vdw_refined
0.197
0.2
19
X-RAY DIFFRACTION
r_symmetry_vdw_other
0.312
0.2
65
X-RAY DIFFRACTION
r_symmetry_hbond_refined
0.376
0.2
15
X-RAY DIFFRACTION
r_mcbond_it
1.254
1.5
1420
X-RAY DIFFRACTION
r_mcangle_it
2.207
2
2304
X-RAY DIFFRACTION
r_scbond_it
2.941
3
958
X-RAY DIFFRACTION
r_scangle_it
4.747
4.5
915
LS精密化 シェル
解像度: 1.9→1.947 Å / Total num. of bins used: 20
Rfactor
反射数
%反射
Rfree
0.285
117
-
Rwork
0.251
2215
-
obs
-
3191
98.8 %
精密化
*PLUS
最高解像度: 1.89 Å / 最低解像度: 25 Å / Rfactor Rfree: 0.222 / Rfactor Rwork: 0.191