+データを開く
-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1prq | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | ACANTHAMOEBA CASTELLANII PROFILIN IA | ||||||
要素 | PROFILIN IA | ||||||
キーワード | CONTRACTILE PROTEIN / ACTIN-BINDING PROTEIN (アクチン結合タンパク質) | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 sequestering of actin monomers / actin monomer binding / マイクロフィラメント / 細胞皮質 / actin cytoskeleton organization 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Acanthamoeba castellanii (カステラーニアメーバ) | ||||||
手法 | X線回折 / 分子置換 / 解像度: 2.5 Å | ||||||
データ登録者 | Fedorov, A.A. / Pollard, T.D. / Way, M. / Lattman, E.E. / Almo, S.C. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Struct.Biol. / 年: 1998 タイトル: Crystal packing induces a conformational change in profilin-I from Acanthamoeba castellanii. 著者: Liu, S. / Fedorov, A.A. / Pollard, T.D. / Lattman, E.E. / Almo, S.C. / Magnus, K.A. #1: ジャーナル: Structure / 年: 1997 タイトル: The Molecular Basis for Allergen Cross-Reactivity: Crystal Structure and Ige-Epitope Mapping of Birch Pollen Profilin 著者: Fedorov, A.A. / Ball, T. / Mahoney, N.M. / Valenta, R. / Almo, S.C. #2: ジャーナル: Proc.Natl.Acad.Sci.USA / 年: 1994 タイトル: X-Ray Structures of Isoforms of the Actin-Binding Protein Profilin that Differ in Their Affinity for Phosphatidylinositol Phosphates 著者: Fedorov, A.A. / Magnus, K.A. / Graupe, M.H. / Lattman, E.E. / Pollard, T.D. / Almo, S.C. #3: ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1994 タイトル: Purification, Characterization and Crystallization of Acanthamoeba Profilin Expressed in Escherichia Coli 著者: Almo, S.C. / Pollard, T.D. / Way, M. / Lattman, E.E. #4: ジャーナル: Annu.Rev.Cell Biol. / 年: 1994 タイトル: Structure of Actin Binding Proteins: Insights About Function at Atomic Resolution 著者: Pollard, T.D. / Almo, S. / Quirk, S. / Vinson, V. / Lattman, E.E. | ||||||
履歴 |
|
-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
---|
-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1prq.cif.gz | 35.1 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | pdb1prq.ent.gz | 24 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1prq.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/pr/1prq ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/pr/1prq | HTTPS FTP |
---|
-関連構造データ
関連構造データ | 1acfS S: 精密化の開始モデル |
---|---|
類似構造データ |
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
| ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| ||||||||
単位格子 |
|
-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 12962.446 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Acanthamoeba castellanii (カステラーニアメーバ) 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P68696 |
---|---|
#2: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1 |
---|
-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.02 Å3/Da / 溶媒含有率: 40 % |
---|---|
結晶化 | pH: 8 / 詳細: 1.5 M SODIUM POTASSIUM TARTRATE, pH 8.0 |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 290 K |
---|---|
放射光源 | 由来: 回転陽極 / 波長: 1.5418 |
検出器 | タイプ: SIEMENS / 検出器: AREA DETECTOR / 日付: 1991 |
放射 | モノクロメーター: GRAPHITE(002) / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.5→43.1 Å / Num. obs: 3255 / % possible obs: 82.76 % / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 2.9 % / Rmerge(I) obs: 0.049 / Net I/σ(I): 19.9 |
-解析
ソフトウェア |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | 構造決定の手法: 分子置換 開始モデル: REFINED ACANTHAMOEBA PROFILIN IB STRUCTURE (1ACF) 解像度: 2.5→8 Å / σ(F): 2 /
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Refine analyze | Luzzati coordinate error obs: 0.23 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.5→8 Å
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
|