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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1prq | ||||||
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タイトル | ACANTHAMOEBA CASTELLANII PROFILIN IA | ||||||
![]() | PROFILIN IA | ||||||
![]() | CONTRACTILE PROTEIN / ACTIN-BINDING PROTEIN | ||||||
機能・相同性 | ![]() sequestering of actin monomers / actin monomer binding / actin cytoskeleton / cell cortex / actin cytoskeleton organization 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Fedorov, A.A. / Pollard, T.D. / Way, M. / Lattman, E.E. / Almo, S.C. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal packing induces a conformational change in profilin-I from Acanthamoeba castellanii. 著者: Liu, S. / Fedorov, A.A. / Pollard, T.D. / Lattman, E.E. / Almo, S.C. / Magnus, K.A. #1: ![]() タイトル: The Molecular Basis for Allergen Cross-Reactivity: Crystal Structure and Ige-Epitope Mapping of Birch Pollen Profilin 著者: Fedorov, A.A. / Ball, T. / Mahoney, N.M. / Valenta, R. / Almo, S.C. #2: ![]() タイトル: X-Ray Structures of Isoforms of the Actin-Binding Protein Profilin that Differ in Their Affinity for Phosphatidylinositol Phosphates 著者: Fedorov, A.A. / Magnus, K.A. / Graupe, M.H. / Lattman, E.E. / Pollard, T.D. / Almo, S.C. #3: ![]() タイトル: Purification, Characterization and Crystallization of Acanthamoeba Profilin Expressed in Escherichia Coli 著者: Almo, S.C. / Pollard, T.D. / Way, M. / Lattman, E.E. #4: ![]() タイトル: Structure of Actin Binding Proteins: Insights About Function at Atomic Resolution 著者: Pollard, T.D. / Almo, S. / Quirk, S. / Vinson, V. / Lattman, E.E. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 35.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 24 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 1acfS S: 精密化の開始モデル |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 12962.446 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 発現宿主: ![]() ![]() |
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#2: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.02 Å3/Da / 溶媒含有率: 40 % |
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結晶化 | pH: 8 / 詳細: 1.5 M SODIUM POTASSIUM TARTRATE, pH 8.0 |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 290 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: SIEMENS / 検出器: AREA DETECTOR / 日付: 1991 |
放射 | モノクロメーター: GRAPHITE(002) / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.5→43.1 Å / Num. obs: 3255 / % possible obs: 82.76 % / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 2.9 % / Rmerge(I) obs: 0.049 / Net I/σ(I): 19.9 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: REFINED ACANTHAMOEBA PROFILIN IB STRUCTURE (1ACF) 解像度: 2.5→8 Å / σ(F): 2 /
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Refine analyze | Luzzati coordinate error obs: 0.23 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.5→8 Å
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拘束条件 |
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