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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1pnn | |||||||||
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タイトル | PEPTIDE NUCLEIC ACID (PNA) COMPLEXED WITH DNA | |||||||||
要素 |
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キーワード | PEPTIDE NUCLEIC ACID/DNA / HAIRPIN PNA:DNA TRIPLEX / TRIPLEX WATSON-CRICK HOOGSTEEN / PEPTIDE NUCLEIC ACID-DNA COMPLEX | |||||||||
機能・相同性 | DNA / DNA (> 10) 機能・相同性情報 | |||||||||
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 解像度: 2.5 Å | |||||||||
データ登録者 | Betts, L. / Veal, J.M. | |||||||||
引用 | ジャーナル: Science / 年: 1995 タイトル: A Nucleic Acid Triple Helix Formed by a Peptide Nucleic Acid-DNA Complex 著者: Betts, L. / Josey, J.A. / Veal, J.M. / Jordan, S.R. #1: ジャーナル: Science / 年: 1994 タイトル: NMR Solution Structure of a Peptide Nucleic Acid Complexed with RNA 著者: Brown, S.C. / Thomson, S.A. / Veal, J.M. / Davis, D.G. | |||||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1pnn.cif.gz | 58 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1pnn.ent.gz | 49.5 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1pnn.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1pnn_validation.pdf.gz | 444.9 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1pnn_full_validation.pdf.gz | 491.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1pnn_validation.xml.gz | 11.1 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1pnn_validation.cif.gz | 13 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/pn/1pnn ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/pn/1pnn | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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非結晶学的対称性 (NCS) | NCS oper: (Code: given Matrix: (-0.545117, -0.361267, -0.756527), ベクター: |
-要素
#1: DNA鎖 | 分子量: 5322.071 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 #2: DNA鎖 | 分子量: 2837.900 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 詳細: CRYSTALLIZED FROM AMMONIUM SULFATE AND TRIS PH 8.5 #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.31 Å3/Da / 溶媒含有率: 62.79 % |
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結晶化 | pH: 8.5 / 詳細: pH 8.5 |
-データ収集
回折 |
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放射光源 |
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検出器 |
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放射 |
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放射波長 |
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反射 | 解像度: 2.5→20 Å / Num. obs: 8374 / % possible obs: 93 % / Observed criterion σ(I): 1 / 冗長度: 3 % / Rmerge(I) obs: 0.043 |
-解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.5→6 Å / σ(F): 2
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Refine analyze | Luzzati coordinate error obs: 0.25 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.5→6 Å
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拘束条件 |
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