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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1pfd | ||||||
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タイトル | THE SOLUTION STRUCTURE OF HIGH PLANT PARSLEY [2FE-2S] FERREDOXIN, NMR, 18 STRUCTURES | ||||||
要素 | FERREDOXIN | ||||||
キーワード | ELECTRON TRANSPORT / [2FE-2S] FERREDOXIN / SOLUTION STRUCTURE / PARAMAGNETISM / NUCLEAR RELAXATION | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 chloroplast / 2 iron, 2 sulfur cluster binding / electron transfer activity / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Petroselinum crispum (オランダゼリ) | ||||||
手法 | 溶液NMR / distance geometry | ||||||
データ登録者 | Im, S.-C. / Liu, G. / Luchinat, C. / Sykes, A.G. / Bertini, I. | ||||||
引用 | ジャーナル: Eur.J.Biochem. / 年: 1998 タイトル: The solution structure of parsley [2Fe-2S]ferredoxin. 著者: Im, S.C. / Liu, G. / Luchinat, C. / Sykes, A.G. / Bertini, I. #1: ジャーナル: Biochemistry / 年: 1996 タイトル: Structure of Synechococcus Elongatus [Fe2S2] Ferredoxin in Solution 著者: Baumann, B. / Sticht, H. / Scharpf, M. / Sutter, M. / Haehnel, W. / Rosch, P. #2: ジャーナル: Biochemistry / 年: 1995 タイトル: 1H and 15N NMR Sequential Assignment, Secondary Structure, and Tertiary Fold of [2Fe-2S] Ferredoxin from Synechocystis Sp. Pcc 6803 著者: Lelong, C. / Setif, P. / Bottin, H. / Andre, F. / Neumann, J.M. #3: ジャーナル: Biochemistry / 年: 1994 タイトル: An NMR-Derived Model for the Solution Structure of Oxidized Putidaredoxin, a 2-Fe, 2-S Ferredoxin from Pseudomonas 著者: Pochapsky, T.C. / Ye, X.M. / Ratnaswamy, G. / Lyons, T.A. #4: ジャーナル: Biochemistry / 年: 1990 タイトル: Multinuclear Magnetic Resonance Studies of the 2Fe(Dot)2Sferredoxin from Anabaena Species Strain Pcc 7120. 1. Sequence-Specific Hydrogen-1 Resonance Assignments and Secondary Structure ...タイトル: Multinuclear Magnetic Resonance Studies of the 2Fe(Dot)2Sferredoxin from Anabaena Species Strain Pcc 7120. 1. Sequence-Specific Hydrogen-1 Resonance Assignments and Secondary Structure in Solution of the Oxidized Form 著者: Oh, B.H. / Markley, J.L. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1pfd.cif.gz | 493.1 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1pfd.ent.gz | 409.4 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1pfd.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1pfd_validation.pdf.gz | 376.8 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1pfd_full_validation.pdf.gz | 485.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1pfd_validation.xml.gz | 27.1 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1pfd_validation.cif.gz | 46.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/pf/1pfd ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/pf/1pfd | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 10496.383 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Petroselinum crispum (オランダゼリ) / 器官: LEAVES / 参照: UniProt: Q7M1S1, EC: 1.7.7.2 |
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#2: 化合物 | ChemComp-FES / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: MODEL NUMBER 1 WAS DETERMINED USING 2D NMR SPECTROSCOPY |
-試料調製
詳細 | 内容: WATER |
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試料状態 | イオン強度: 0.10 M / pH: 7.0 / 圧: NORMAL / 温度: 298 K |
結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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-解析
ソフトウェア |
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NMR software |
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精密化 | 手法: distance geometry / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: LEAST TARGET FUNCTION / 計算したコンフォーマーの数: 50 / 登録したコンフォーマーの数: 18 |