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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1paz | ||||||
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タイトル | REFINEMENT OF THE STRUCTURE OF PSEUDOAZURIN FROM ALCALIGENES FAECALIS S-6 AT 1.55 ANGSTROMS RESOLUTION | ||||||
![]() | PSEUDOAZURIN PRECURSOR | ||||||
![]() | ELECTRON TRANSFER(CUPROPROTEIN) | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Petratos, K. / Dauter, Z. / Wilson, K.S. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Refinement of the structure of pseudoazurin from Alcaligenes faecalis S-6 at 1.55 A resolution. 著者: Petratos, K. / Dauter, Z. / Wilson, K.S. #1: ![]() タイトル: The Crystal Structure of Pseudoazurin from Alcaligenes Faecalis S-6 Determined at 2.9 Angstroms Resolution 著者: Petratos, K. / Banner, D.W. / Beppu, T. / Wilson, K.S. / Tsernoglou, D. | ||||||
履歴 |
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Remark 700 | SHEET THE NINE-STRANDED SHEET DESCRIBED ON THE *SHEET* RECORDS BELOW IS ACTUALLY AN EIGHT-STRANDED ...SHEET THE NINE-STRANDED SHEET DESCRIBED ON THE *SHEET* RECORDS BELOW IS ACTUALLY AN EIGHT-STRANDED BETA BARREL. THIS IS DENOTED BY THE FIRST STRAND RECURRING AS THE LAST STRAND. STRAND 8 IS ADJACENT TO STRAND 9 (IDENTICAL TO STRAND 1) BUT THERE ARE NO HYDROGEN BONDS BETWEEN STRANDS 8 AND 9. THE STRANDS ARE IDENTIFIED AS 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, AND 9 ON THE *SHEET* RECORDS BELOW AND AS STRANDS 5, 4, 7, 8, 2, 1, 3, 6, AND 5 IN THE PAPER CITED AS REFERENCE 1 ABOVE. |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 37.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 25.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: RESIDUE PRO 20 IS A CIS PROLINE. |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 13383.511 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 参照: UniProt: P04377 |
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#2: 化合物 | ChemComp-CU / |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.65 Å3/Da / 溶媒含有率: 53.66 % |
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結晶化 | *PLUS 手法: unknown |
-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.55 Å / Num. obs: 19770 / Num. measured all: 108356 / Rmerge(I) obs: 0.079 |
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解析
ソフトウェア | 名称: PROLSQ / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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精密化 | 解像度: 1.55→9 Å / Rfactor obs: 0.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.55→9 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS Rfactor obs: 0.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |