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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1p1l | ||||||
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タイトル | Structure of the Periplasmic divalent cation tolerance protein CutA from Archaeoglobus fulgidus | ||||||
![]() | Periplasmic divalent cation tolerance protein CUTA | ||||||
![]() | STRUCTURAL GENOMICS / UNKNOWN FUNCTION / T835 / NYSGXRC / PSI / Protein Structure Initiative / New York SGX Research Center for Structural Genomics | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Kniewel, R. / Buglino, J.A. / Lima, C.D. / Burley, S.K. / New York SGX Research Center for Structural Genomics (NYSGXRC) | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structure of the Periplasmic divalent cation tolerance protein CutA from Archaeoglobus fulgidus 著者: Kniewel, R. / Buglino, J.A. / Lima, C.D. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 32.6 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 22.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | |
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類似構造データ | |
その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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2 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 11900.855 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() |
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#2: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.51 Å3/Da / 溶媒含有率: 50.6 % |
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結晶化 | 温度: 291 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 5.6 詳細: 21% PEG 1500, 0.1M Na Citrate pH 5.6, 3% MPD, 0.15M Magnesium Chloride, 0.2M Ammonium Sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K |
-データ収集
回折 |
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放射光源 |
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検出器 |
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放射 |
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放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 | ||||||||||||||||||
反射 | 解像度: 2→20 Å / Num. all: 8551 / Num. obs: 8551 / % possible obs: 93.7 % / Observed criterion σ(F): 0 / Observed criterion σ(I): 0 / Biso Wilson estimate: 25.6 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.048 / Net I/σ(I): 37.3 | ||||||||||||||||||
反射 シェル | 解像度: 2→2.07 Å / Rmerge(I) obs: 0.118 / Mean I/σ(I) obs: 11 / % possible all: 79.5 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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溶媒の処理 | 溶媒モデル: FLAT MODEL / Bsol: 52.6094 Å2 / ksol: 0.398561 e/Å3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 26 Å2
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Refine analyze | Luzzati coordinate error free: 0.27 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2→19.4 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル | 解像度: 2→2.07 Å / Rfactor Rfree error: 0.031 / Total num. of bins used: 10
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Xplor file |
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