登録情報 | データベース: PDB / ID: 1nxc |
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タイトル | Structure of mouse Golgi alpha-1,2-mannosidase IA reveals the molecular basis for substrate specificity among Class I enzymes (family 47 glycosidases) |
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要素 | Mannosyl-oligosaccharide 1,2-alpha-mannosidase IA |
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キーワード | HYDROLASE / mannosidase / glycosidase / Structural Genomics / PSI / Protein Structure Initiative / Southeast Collaboratory for Structural Genomics / SECSG |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
Progressive trimming of alpha-1,2-linked mannose residues from Man9/8/7GlcNAc2 to produce Man5GlcNAc2 / mannosyl-oligosaccharide 1,2-alpha-mannosidase / mannosyl-oligosaccharide 1,2-alpha-mannosidase activity / protein glycosylation / carbohydrate metabolic process / Golgi membrane / calcium ion binding / endoplasmic reticulum類似検索 - 分子機能 : / Glycoside hydrolase family 47 / Seven-hairpin glycosidases / Glycosyl hydrolase family 47 / Glycosyltransferase - #10 / Six-hairpin glycosidase-like superfamily / Glycosyltransferase / Alpha/alpha barrel / Mainly Alpha類似検索 - ドメイン・相同性 Mannosyl-oligosaccharide 1,2-alpha-mannosidase IA類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_mammal.gif) Mus musculus (ハツカネズミ) |
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手法 | X線回折 / 分子置換 / 解像度: 1.51 Å |
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データ登録者 | Tempel, W. / Liu, Z.-J. / Karaveg, K. / Rose, J. / Moremen, K.W. / Wang, B.-C. / Southeast Collaboratory for Structural Genomics (SECSG) |
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引用 | ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2004 タイトル: Structure of mouse Golgi alpha-mannosidase IA reveals the molecular basis for substrate specificity among class 1 (family 47 glycosylhydrolase) alpha1,2-mannosidases 著者: Tempel, W. / Karaveg, K. / Liu, Z.-J. / Rose, J. / Wang, B.-C. / Moremen, K.W. |
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履歴 | 登録 | 2003年2月10日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2004年5月4日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2008年4月29日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Non-polymer description / Version format compliance |
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改定 1.3 | 2017年10月11日 | Group: Refinement description / カテゴリ: software |
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改定 2.0 | 2020年7月29日 | Group: Atomic model / Data collection ...Atomic model / Data collection / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: atom_site / chem_comp ...atom_site / chem_comp / entity / pdbx_branch_scheme / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_branch / pdbx_entity_branch_descriptor / pdbx_entity_branch_link / pdbx_entity_branch_list / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_struct_assembly_gen / pdbx_struct_conn_angle / struct_asym / struct_conn / struct_site / struct_site_gen Item: _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ..._atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.label_asym_id / _atom_site.label_entity_id / _chem_comp.name / _chem_comp.type / _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.pdbx_role / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation |
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