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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1ns4 | ||||||
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タイトル | Crystal structure of galactose mutarotase from Lactococcus lactis mutant E304Q complexed with glucose | ||||||
![]() | GALACTOSE MUTAROTASE | ||||||
![]() | ISOMERASE / MUTAROTASE / EPIMERASE / GALACTOSE METABOLISM | ||||||
機能・相同性 | ![]() aldose 1-epimerase / aldose 1-epimerase activity / galactose catabolic process via UDP-galactose / glucose metabolic process / carbohydrate binding / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Holden, H.M. / Thoden, J.B. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: The Catalytic Mechanism of Galactose Mutarotase 著者: Thoden, J.B. / Kim, J. / Raushel, F.M. / Holden, H.M. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 158.5 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 122 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 460.5 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 479.7 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 32.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 47.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 1ns0C ![]() 1ns2C ![]() 1ns7C ![]() 1ns8C ![]() 1nsmC ![]() 1nsrC ![]() 1nssC ![]() 1nsuC ![]() 1nsvC ![]() 1nsxC ![]() 1nszC ![]() 1l7jS C: 同じ文献を引用 ( S: 精密化の開始モデル |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 38621.973 Da / 分子数: 2 / 変異: E304Q / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() #2: 糖 | #3: 化合物 | ChemComp-NA / | #4: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.18 Å3/Da / 溶媒含有率: 43.09 % | ||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | 温度: 277 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 6 詳細: MES, methylether-PEG-5000, NaCl, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K | ||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 温度: 4 ℃ / pH: 6 / 手法: 蒸気拡散法 | ||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 277 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: SIEMENS HI-STAR / 検出器: AREA DETECTOR / 日付: 2002年5月26日 / 詳細: GOEBEL MIRRORS |
放射 | モノクロメーター: GOEBEL OPTICS / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.54178 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.85→30 Å / Num. all: 60006 / Num. obs: 60006 / % possible obs: 95.6 % / Observed criterion σ(F): 0 / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 2.9 % / Rsym value: 0.04 / Net I/σ(I): 18.6 |
反射 シェル | 解像度: 1.85→1.93 Å / 冗長度: 1.9 % / Mean I/σ(I) obs: 4.2 / Num. unique all: 6907 / Rsym value: 0.183 / % possible all: 93.7 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.85 Å / 最低解像度: 30 Å / Rmerge(I) obs: 0.0401 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: PDB ENTRY 1L7J 解像度: 1.85→30 Å / σ(F): 0 / σ(I): 0 / 立体化学のターゲット値: ENGH & HUBER
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.85→30 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS 最低解像度: 30 Å / Num. reflection obs: 53664 | |||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | |||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | |||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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