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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1nre | ||||||
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タイトル | RECEPTOR ASSOCIATED PROTEIN (RAP) DOMAIN 1, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE | ||||||
要素 | RECEPTOR-ASSOCIATED PROTEIN | ||||||
キーワード | CELL SURFACE PROTEIN / ALPHA2MACROGLOBULIN RECEPTOR ASSOCIATED PROTEIN / LOW DENSITY LIPOPROTEIN RECEPTOR FAMILY ASSOCIATED PROTEIN / LDLR FAMILY ASSOCIATED PROTEIN / HELIX BUNDLE | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 extracellular negative regulation of signal transduction / lipase binding / negative regulation of very-low-density lipoprotein particle clearance / regulation of receptor-mediated endocytosis / rough endoplasmic reticulum lumen / receptor antagonist activity / amyloid-beta clearance by transcytosis / negative regulation of amyloid-beta clearance / very-low-density lipoprotein particle receptor binding / positive regulation of amyloid-beta clearance ...extracellular negative regulation of signal transduction / lipase binding / negative regulation of very-low-density lipoprotein particle clearance / regulation of receptor-mediated endocytosis / rough endoplasmic reticulum lumen / receptor antagonist activity / amyloid-beta clearance by transcytosis / negative regulation of amyloid-beta clearance / very-low-density lipoprotein particle receptor binding / positive regulation of amyloid-beta clearance / cis-Golgi network / negative regulation of receptor internalization / low-density lipoprotein particle receptor binding / endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment / endomembrane system / negative regulation of protein binding / endosome lumen / Golgi lumen / heparin binding / amyloid-beta binding / receptor ligand activity / endosome / signaling receptor binding / Golgi apparatus / cell surface / endoplasmic reticulum / signal transduction / extracellular region / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Homo sapiens (ヒト) | ||||||
手法 | 溶液NMR / DG, MD | ||||||
データ登録者 | Nielsen, P.R. / Poulsen, F.M. | ||||||
引用 | ジャーナル: Proc.Natl.Acad.Sci.USA / 年: 1997 タイトル: The solution structure of the N-terminal domain of alpha2-macroglobulin receptor-associated protein. 著者: Nielsen, P.R. / Ellgaard, L. / Etzerodt, M. / Thogersen, H.C. / Poulsen, F.M. #1: ジャーナル: To be Published タイトル: Alpha2-Macroglobulin Receptor Associated Proteins Consist of Three Domains with Similar Structural Motifs. The 1H, 15N, and 13C Chemical Shift Assignments and Secondary Structure of the ...タイトル: Alpha2-Macroglobulin Receptor Associated Proteins Consist of Three Domains with Similar Structural Motifs. The 1H, 15N, and 13C Chemical Shift Assignments and Secondary Structure of the Truncated N-Terminal Domain of Human RAP 著者: Nielsen, P.R. / Ellgaard, L. / Jensen, P.H. / Thoegersen, H.C. / Poulsen, F.M. #2: ジャーナル: Eur.J.Biochem. / 年: 1997 タイトル: Dissection of the Domain Architecture of the Alpha2Macroglobulin-Receptor-Associated Protein 著者: Ellgaard, L. / Holtet, T.L. / Nielsen, P.R. / Etzerodt, M. / Gliemann, J. / Thogersen, H.C. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1nre.cif.gz | 39 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1nre.ent.gz | 27.9 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1nre.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1nre_validation.pdf.gz | 243 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1nre_full_validation.pdf.gz | 242.7 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1nre_validation.xml.gz | 3.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1nre_validation.cif.gz | 4.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/nr/1nre ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/nr/1nre | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 9536.008 Da / 分子数: 1 / 断片: N-TERMINAL DOMAIN, DOMAIN 1, RESIDUES 17 - 97 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 細胞株: BL21 / プラスミド: PT=7=H=6=UB / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21 (DE3) PLYSS / 参照: UniProt: P30533 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR |
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-試料調製
試料状態 | pH: 6.4 / 温度: 298 K |
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結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker AMX / 製造業者: Bruker / モデル: AMX / 磁場強度: 600 MHz |
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-解析
ソフトウェア |
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NMR software |
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精密化 | 手法: DG, MD / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: LOWEST ENERGY / 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 1 |