登録情報 | データベース: PDB / ID: 1nmy |
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タイトル | Crystal structure of human thymidylate kinase with FLTMP and AppNHp |
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要素 | similar to THYMIDYLATE KINASE (DTMP KINASE) |
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キーワード | TRANSFERASE / thymidylate kinase / p-loop / fluorothymidine |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
thymidine biosynthetic process / dUDP biosynthetic process / dTMP kinase / thymidylate kinase activity / dTDP biosynthetic process / Interconversion of nucleotide di- and triphosphates / myoblast differentiation / nucleoside diphosphate kinase activity / dTTP biosynthetic process / response to cadmium ion ...thymidine biosynthetic process / dUDP biosynthetic process / dTMP kinase / thymidylate kinase activity / dTDP biosynthetic process / Interconversion of nucleotide di- and triphosphates / myoblast differentiation / nucleoside diphosphate kinase activity / dTTP biosynthetic process / response to cadmium ion / cellular response to growth factor stimulus / response to estrogen / mitochondrial matrix / mitochondrion / ATP binding / nucleus / cytoplasm / cytosol類似検索 - 分子機能 Thymidylate kinase, conserved site / Thymidylate kinase signature. / Thymidylate kinase / Thymidylate kinase-like domain / Thymidylate kinase / P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases / Rossmann fold / P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE / PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER / 3'-FLUORO-3'-DEOXYTHYMIDINE MONOPHOSPHATE / Thymidylate kinase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Homo sapiens (ヒト) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / フーリエ合成 / 解像度: 1.6 Å |
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データ登録者 | Ostermann, N. / Segura-Pena, D. / Meier, C. / Veit, T. / Monnerjahn, M. / Konrad, M. / Lavie, A. |
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引用 | ジャーナル: Biochemistry / 年: 2003 タイトル: Structures of human thymidylate kinase in complex with prodrugs: implications for the structure-based design of novel compounds 著者: Ostermann, N. / Segura-Pena, D. / Meier, C. / Veit, T. / Monnerjahn, M. / Konrad, M. / Lavie, A. |
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履歴 | 登録 | 2003年1月12日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2003年3月18日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2008年4月29日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Derived calculations / Version format compliance |
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改定 1.3 | 2017年10月11日 | Group: Refinement description / カテゴリ: software |
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改定 1.4 | 2021年10月27日 | Group: Data collection / Database references / Derived calculations カテゴリ: database_2 / diffrn_source ...database_2 / diffrn_source / pdbx_struct_conn_angle / pdbx_struct_special_symmetry / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id / _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_symmetry / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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改定 1.5 | 2024年2月14日 | Group: Data collection / カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond |
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