+データを開く
-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1mxl | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | STRUCTURE OF CARDIAC TROPONIN C-TROPONIN I COMPLEX | ||||||
要素 |
| ||||||
キーワード | CALCIUM-BINDING PROTEIN / TROPONIN / MUSCLE CONTRACTION / REGULATORY PROTEIN | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 regulation of systemic arterial blood pressure by ischemic conditions / regulation of muscle filament sliding speed / troponin T binding / diaphragm contraction / troponin C binding / regulation of ATP-dependent activity / cardiac Troponin complex / cardiac myofibril / regulation of smooth muscle contraction / troponin complex ...regulation of systemic arterial blood pressure by ischemic conditions / regulation of muscle filament sliding speed / troponin T binding / diaphragm contraction / troponin C binding / regulation of ATP-dependent activity / cardiac Troponin complex / cardiac myofibril / regulation of smooth muscle contraction / troponin complex / regulation of muscle contraction / transition between fast and slow fiber / negative regulation of ATP-dependent activity / Striated Muscle Contraction / regulation of cardiac muscle contraction by calcium ion signaling / response to metal ion / ventricular cardiac muscle tissue morphogenesis / myosin II complex / heart contraction / troponin I binding / skeletal muscle contraction / calcium channel inhibitor activity / vasculogenesis / cardiac muscle contraction / Ion homeostasis / sarcomere / intracellular calcium ion homeostasis / calcium-dependent protein binding / actin filament binding / actin binding / heart development / protein domain specific binding / calcium ion binding / protein kinase binding / protein homodimerization activity / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Homo sapiens (ヒト) | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
データ登録者 | Li, M.X. / Spyracopoulos, L. / Sykes, B.D. | ||||||
引用 | ジャーナル: Biochemistry / 年: 1999 タイトル: Binding of cardiac troponin-I147-163 induces a structural opening in human cardiac troponin-C. 著者: Li, M.X. / Spyracopoulos, L. / Sykes, B.D. | ||||||
履歴 |
|
-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
---|
-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1mxl.cif.gz | 1.2 MB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | pdb1mxl.ent.gz | 1 MB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1mxl.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1mxl_validation.pdf.gz | 357.4 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | 1mxl_full_validation.pdf.gz | 948.7 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1mxl_validation.xml.gz | 102.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1mxl_validation.cif.gz | 144.8 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/mx/1mxl ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/mx/1mxl | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
| |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| |||||||||
NMR アンサンブル |
|
-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 10070.304 Da / 分子数: 1 / 断片: REGULATORY N-DOMAIN RESIDUES 1-89 / 由来タイプ: 組換発現 詳細: CALCIUM SATURATED N-DOMAIN OF CARDIAC TROPONIN C IN COMPLEX WITH CARDIAC TROPONIN I 147-163 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 株: BL21(DE3) PLYSS / 組織: MUSCLE / 解説: HOMO SAPIENS / 器官: HEART / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) PLYSS / 組織 (発現宿主): MUSCLE / 参照: UniProt: P63316 |
---|---|
#2: タンパク質・ペプチド | 分子量: 1806.183 Da / 分子数: 1 / 断片: CARDIAC TROPONIN I RESIDUES 147-163 / 由来タイプ: 合成 詳細: THIS PEPTIDE WAS CHEMICALLY SYNTHESIZED. ITS PARENT PROTEIN IS NATURALLY FOUND IN HEART TISSUE OF HOMO SAPIENS (HUMAN). 参照: UniProt: P19429 |
#3: 化合物 | ChemComp-CA / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NMR実験 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NMR実験の詳細 | Text: THE STRUCTURE WAS DETERMINED USING TRIPLE-RESONANCE NMR SPECTROSCOPY ON 13C, 15N-LABELED TROPONIN C AND A SYNTHETIC TROPONIN I PEPTIDE |
-試料調製
詳細 | 内容: 10% WATER/90% D2O |
---|---|
試料状態 | pH: 6.7 / 圧: 1 atm / 温度: 303 K |
結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
|
---|
-解析
NMR software |
| ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 詳細: REFINEMENT DETAILS CAN BE FOUND IN THE JRNL CITATION ABOVE. | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: LEAST RESTRAINT VIOLATION 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 40 |