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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1msp | ||||||
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タイトル | MAJOR SPERM PROTEIN, ALPHA ISOFORM (RECOMBINANT), PH 4.6 | ||||||
![]() | MAJOR SPERM PROTEIN | ||||||
![]() | CELL MOTILITY PROTEIN / CYTOSKELETAL PROTEIN / SPERM | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Bullock, T.L. / Roberts, T.M. / Stewart, M. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: 2.5 A resolution crystal structure of the motile major sperm protein (MSP) of Ascaris suum. 著者: Bullock, T.L. / Roberts, T.M. / Stewart, M. #1: ![]() タイトル: Worm Sperm and Advances in Cell Locomotion 著者: Theriot, J.A. #2: ![]() タイトル: New Crystal Forms of the Motile Major Sperm Protein (Msp) of Ascaris Suum 著者: Bullock, T.L. / Parthasarathy, G. / King, K.L. / Kent, H.M. / Roberts, T.M. / Stewart, M. #3: ![]() タイトル: Nematode Sperm Locomotion 著者: Roberts, T.M. / Stewart, M. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 60.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 44.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 14278.107 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 詳細: ALPHA ISOFORM, PH 4.6 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() #2: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.35 Å3/Da / 溶媒含有率: 50 % | ||||||||||||||||||||
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結晶化 | pH: 4.6 / 詳細: pH 4.6 | ||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 手法: 蒸気拡散法 | ||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射光源 | 波長: 1.5418 |
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検出器 | タイプ: MARRESEARCH / 検出器: IMAGE PLATE |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | Num. obs: 8858 / % possible obs: 95 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 1.9 % / Rmerge(I) obs: 0.046 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.5 Å / 最低解像度: 21 Å |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.5→20 Å / Num. reflection obs: 8478 / σ(F): 0 / 立体化学のターゲット値: TNT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.5→20 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: TNT / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS 最低解像度: 21 Å / % reflection Rfree: 5 % / Rfactor obs: 0.195 / Rfactor Rfree: 0.292 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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