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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1mcs | ||||||
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タイトル | PRINCIPLES AND PITFALLS IN DESIGNING SITE DIRECTED PEPTIDE LIGANDS | ||||||
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![]() | IMMUNOGLOBULIN | ||||||
機能・相同性 | Immunoglobulins / Immunoglobulin-like / Sandwich / Mainly Beta / : ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Edmundson, A.B. / Harris, D.L. / Fan, Z.-C. / Guddat, L.W. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Principles and pitfalls in designing site-directed peptide ligands. 著者: Edmundson, A.B. / Harris, D.L. / Fan, Z.C. / Guddat, L.W. / Schley, B.T. / Hanson, B.L. / Tribbick, G. / Geysen, H.M. #1: ![]() タイトル: The Binding of Opioid Peptides to the Mcg Light Chain Dimer: Flexible Keys and Adjustable Locks 著者: Edmundson, A.B. / Ely, K.R. / Herron, J.N. / Cheson, B.D. #2: ![]() タイトル: Binding of N-Formylated Chemotactic Peptides in Crystals of the Mcg Light Chain Dimer: Similarities with Neutrophil Receptors 著者: Edmundson, A.B. / Ely, K.R. #3: ![]() タイトル: A Search for Site-Filling Ligands in the Mcg Bence-Jones Dimer: Crystal Binding Studies of Fluorescent Compounds 著者: Edmundson, A.B. / Ely, K.R. / Herron, J.N. / Cheson, B.D. #4: ![]() タイトル: Binding of 2,4-Dinitrophenyl Compounds and Other Small Molecules to a Crystalline Lambdal-Type Bence-Jones Dimer 著者: Edmundson, A.B. / Ely, K.R. / Girling, R.L. / Abola, E.E. / Schiffer, M. / Westholm, F.A. / Fausch, M.D. / Deutsch, H.F. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 79.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 63.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 386.4 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 417.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 13.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 19.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: CIS PROLINE - PRO A 145 / 2: CIS PROLINE - PRO A 168 / 3: CIS PROLINE - PRO B 145 4: CIS PROLINE - PRO P 4 RESIDUES PHE P 2 AND PRO P 4 ARE D AMINO ACIDS. |
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要素
#1: 抗体 | 分子量: 22819.080 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() #2: タンパク質・ペプチド | | 分子量: 554.617 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 配列の詳細 | THE LIGHT CHAIN WAS SEQUENCED BY FETT AND DEUTSCH (1974) BIOCHEMIST | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.03 Å3/Da / 溶媒含有率: 59.46 % | ||||||||||||||||||||
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結晶化 | 詳細: THE COMPLEX WAS PREPARED BY DIFFUSION OF THE PEPTIDE INTO THE CRYSTAL. | ||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS pH: 6.2 / 手法: batch method | ||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
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放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1 Å / 相対比: 1 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.7→6 Å / σ(F): 1.5 /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.7→6 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS 最高解像度: 2.7 Å / 最低解像度: 6 Å / σ(F): 1.5 / Rfactor obs: 0.183 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |