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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1mba | ||||||
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タイトル | APLYSIA LIMACINA MYOGLOBIN. CRYSTALLOGRAPHIC ANALYSIS AT 1.6 ANGSTROMS RESOLUTION | ||||||
![]() | MYOGLOBIN | ||||||
![]() | OXYGEN STORAGE | ||||||
機能・相同性 | ![]() hemoglobin complex / oxygen carrier activity / oxygen binding / oxidoreductase activity / iron ion binding / heme binding / extracellular region 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Bolognesi, M. / Onesti, S. / Gatti, G. / Coda, A. / Ascenzi, P. / Brunori, M. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Aplysia limacina myoglobin. Crystallographic analysis at 1.6 A resolution. 著者: Bolognesi, M. / Onesti, S. / Gatti, G. / Coda, A. / Ascenzi, P. / Brunori, M. #1: ![]() タイトル: Aplysia Limacina Myoglobin. Molecular Bases for Ligand Binding and Reversible Unfolding 著者: Bolognesi, M. / Gatti, G. / Guanziroli, M.G. / Mattevi, A. / Onesti, S. / Coda, A. / Ascenzi, P. / Brunori, M. #2: ![]() タイトル: Crystal Structure of Ferric Aplysia Limacina Myoglobin at 2.0 Angstroms Resolution 著者: Bolognesi, M. / Coda, A. / Gatti, G. / Ascenzi, P. / Brunori, M. #3: ![]() タイトル: Reactivity of Ferric Aplysia and Sperm Whale Myoglobins Towards Imidazole. X-Ray and Binding Study 著者: Bolognesi, M. / Cannillo, E. / Ascenzi, P. / Giacometti, G.M. / Merli, A. / Brunori, M. #4: ![]() タイトル: The Structure of Aplysia Limacina Myoglobin at 3.6 Angstroms Resolution 著者: Bolognesi, M. / Cannillo, E. / Oberti, R. / Rossi, G. / Ungaretti, L. #5: ![]() タイトル: The Crystal Structure of met-Myoglobin from Aplysia Limacina at 5 Angstroms Resolution 著者: Ungaretti, L. / Bolognesi, M. / Cannillo, E. / Oberti, R. / Rossi, G. #6: ![]() タイトル: Crystallization and Preliminary X-Ray Diffraction Studies on met-Myoglobin from Aplysia Limacina 著者: Blundell, T.L. / Brunori, M. / Curti, B. / Bolognesi, M. / Coda, A. / Fumagalli, M. / Ungaretti, L. #7: ![]() タイトル: The Amino Acid Sequence of Myoglobin from the Mollusc Aplysia Limacina 著者: Tentori, L. / Vivaldi, G. / Carta, S. / Marinucci, M. / Massa, A. / Antonini, E. / Brunori, M. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 43 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 29.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 15349.438 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-HEM / |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
構成要素の詳細 | AT PH 7.0 THE DISTAL SITE (THE SIXTH COORDINATI |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 1.98 Å3/Da / 溶媒含有率: 37.94 % | |||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 手法: 蒸気拡散法 / pH: 7 | |||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.6 Å / 最低解像度: 5 Å / Num. obs: 14740 / % possible obs: 0.92 % |
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解析
ソフトウェア | 名称: EREF / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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精密化 | Rfactor Rwork: 0.193 / 最高解像度: 1.6 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 1.6 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS 最高解像度: 1.6 Å / 最低解像度: 5 Å / Num. reflection obs: 14134 / Rfactor obs: 0.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS Biso mean: 21.8 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS タイプ: o_angle_d / Dev ideal: 2.12 |