+
データを開く
-
基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1m7a | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | CANDIDA ALBICANS DIHYDROFOLATE REDUCTASE COMPLEXED WITH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE (NADPH) AND 7-[2-methoxy-1-(methoxymethyl)ethyl]-7H-pyrrolo[3,2-f] quinazoline-1,3-diamine (GW557) | ||||||
![]() | DIHYDROFOLATE REDUCTASE | ||||||
![]() | OXIDOREDUCTASE / ANTIFUNGAL TARGET / REDUCTASE | ||||||
機能・相同性 | ![]() dihydrofolate metabolic process / glycine biosynthetic process / dihydrofolate reductase / dihydrofolate reductase activity / folic acid metabolic process / tetrahydrofolate biosynthetic process / one-carbon metabolic process / NADP binding / mitochondrion / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Whitlow, M. / Howard, A.J. / Kuyper, L.F. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: X-Ray Crystallographic Studies of Candida Albicans Dihydrofolate Reductase. High Resolution Structures of the Holoenzyme and an Inhibited Ternary Complex. 著者: Whitlow, M. / Howard, A.J. / Stewart, D. / Hardman, K.D. / Kuyper, L.F. / Baccanari, D.P. / Fling, M.E. / Tansik, R.L. #1: ![]() タイトル: X-Ray Crystal Structures of Candida Albicans Dihydrofolate Reductase: High Resolution Ternary Complexes in which the Dihydronicotinamide Moiety of Nadph is Displaced by an Inhibitor 著者: Whitlow, M. / Howard, A.J. / Stewart, D. / Hardman, K.D. / Chan, J.H. / Baccanari, D.P. / Tansik, R.L. / Hong, J.S. / Kuyper, L.F. #2: ![]() タイトル: Selective Inhibitors of Candida Albicans Dihydrofolate Reductase: Activity and Selectivity of 5-(Arylthio)-2,4-Diaminoquinazolines 著者: Chan, J.H. / Hong, J.S. / Kuyper, L.F. / Baccanari, D.P. / Joyner, S.S. / Tansik, R.L. / Boytos, C.M. / Rudolph, S.K. #3: ![]() タイトル: Characterization of Candida Albicans Dihydrofolate Reductase 著者: Baccanari, D.P. / Tansik, R.L. / Joyner, S.S. / Fling, M.E. / Smith, P.L. / Freisheim, J.H. | ||||||
履歴 |
|
-
構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
---|
-
ダウンロードとリンク
-
ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 105 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | ![]() | 80.5 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 1.5 MB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | ![]() | 1.5 MB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 24.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 33.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-
リンク
-
集合体
登録構造単位 | ![]()
| ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | ![]()
| ||||||||
2 | ![]()
| ||||||||
単位格子 |
| ||||||||
詳細 | Dihydrofolate reductase is active as a monomer. |
-
要素
#1: タンパク質 | 分子量: 22194.527 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() #2: 化合物 | #3: 化合物 | #4: 水 | ChemComp-HOH / | |
---|
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
---|
-
試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.27 Å3/Da / 溶媒含有率: 43 % |
---|---|
結晶化 | 温度: 277 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 6.5 詳細: dihydro-nicotinamide-adenine-dinucleotide phosphate (NADPH), 7-[2-METHOXY-1-(METHOXYMETHYL)ETHYL]-7H-PYRROLO[3,2-F] QUINAZOLINE-1,3-DIAMINE (GW557), PEG-3350, Potassium 4- ...詳細: dihydro-nicotinamide-adenine-dinucleotide phosphate (NADPH), 7-[2-METHOXY-1-(METHOXYMETHYL)ETHYL]-7H-PYRROLO[3,2-F] QUINAZOLINE-1,3-DIAMINE (GW557), PEG-3350, Potassium 4-morphilineethanesulfonic acid (MES), dithiothreitol (DTT), pH 6.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 293 K |
---|---|
放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: XENTRONICS / 検出器: AREA DETECTOR / 日付: 1989年5月6日 / 詳細: Huber Graphite MONOCHROMATOR |
放射 | モノクロメーター: HUBER GRAPHITE MONOCHROMATOR / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.76→50 Å / Num. obs: 36247 / % possible obs: 94.9 % / Observed criterion σ(F): 0 / Observed criterion σ(I): -3 / 冗長度: 3.18 % / Biso Wilson estimate: 31.86 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.0552 / Rsym value: 0.0552 / Net I/σ(I): 18.55 |
反射 シェル | 解像度: 1.76→1.83 Å / 冗長度: 1.693 % / Rmerge(I) obs: 0.193 / Mean I/σ(I) obs: 2.77 / Num. unique all: 4590 / Rsym value: 0.193 / % possible all: 72.76 |
-
解析
ソフトウェア |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | 構造決定の手法: DIRECT REPLACEMENT 開始モデル: CANDIDA ALBICANS DHFR (PDB ENTRY 1AI9) 解像度: 1.76→10 Å Isotropic thermal model: Konnert, J.H. & Hendrickson, W.A. (1980) Acta Crystallogr. A A36, 344. 交差検証法: NONE / σ(F): 2 / σ(I): -3 立体化学のターゲット値: Hendrickson, W.A. (1985) Methods Enzymol. 115 252-270. 詳細: RESTRAIN LEAST-SQUARES PROCEDURE.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.76→10 Å
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
LS精密化 シェル |
|