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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1m3e | ||||||
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タイトル | Succinyl-COA:3-ketoacid COA transferase from pig heart (selenomethionine) | ||||||
![]() | SUCCINYL-COA:3-KETOACID-COENZYME A TRANSFERASE | ||||||
![]() | TRANSFERASE / alpha/beta protein | ||||||
機能・相同性 | ![]() Utilization of Ketone Bodies / cellular ketone body metabolic process / 3-oxoacid CoA-transferase / succinyl-CoA:3-oxo-acid CoA-transferase activity / ketone body catabolic process / Mitochondrial protein degradation / protein homodimerization activity / mitochondrion 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Bateman, K.S. / Brownie, E.R. / Wolodko, W.T. / Fraser, M.E. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structure of the Mammalian CoA Transferase from Pig Heart 著者: Bateman, K.S. / Brownie, E.R. / Wolodko, W.T. / Fraser, M.E. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 374.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 320.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 52903.586 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() #2: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.19 Å3/Da / 溶媒含有率: 43.73 % | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | 温度: 294 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 8 詳細: PEG 2000, TrisCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294.0K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K | ||||||||||||
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() | ||||||||||||
検出器 | タイプ: ADSC QUANTUM 4 / 検出器: CCD / 日付: 2002年5月6日 | ||||||||||||
放射 | モノクロメーター: Si 111 CHANNEL / プロトコル: MAD / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray | ||||||||||||
放射波長 |
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反射 | 解像度: 2.5→30 Å / Num. all: 62373 / Num. obs: 61401 / % possible obs: 97.9 % / 冗長度: 6.75 % / Rmerge(I) obs: 0.085 / Net I/σ(I): 27.42 | ||||||||||||
反射 シェル | 解像度: 2.5→2.59 Å / Rmerge(I) obs: 0.188 / Mean I/σ(I) obs: 6.99 / % possible all: 84.3 | ||||||||||||
反射 | *PLUS 最低解像度: 30 Å / Num. measured all: 414407 | ||||||||||||
反射 シェル | *PLUS % possible obs: 84.3 % |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.5→30 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS % reflection Rfree: 5 % | |||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | |||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |