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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1lwi | ||||||
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タイトル | 3-ALPHA-HYDROXYSTEROID/DIHYDRODIOL DEHYDROGENASE FROM RATTUS NORVEGICUS | ||||||
![]() | 3-ALPHA-HYDROXYSTEROID/DIHYDRODIOL DEHYDROGENASE | ||||||
![]() | OXIDOREDUCTASE / NAD | ||||||
機能・相同性 | ![]() 3alpha-hydroxysteroid 3-dehydrogenase (Si-specific) / androsterone dehydrogenase (B-specific) activity / steroid dehydrogenase activity / androsterone dehydrogenase activity / ketosteroid monooxygenase activity / progesterone metabolic process / daunorubicin metabolic process / doxorubicin metabolic process / bile acid binding / aldose reductase (NADPH) activity ...3alpha-hydroxysteroid 3-dehydrogenase (Si-specific) / androsterone dehydrogenase (B-specific) activity / steroid dehydrogenase activity / androsterone dehydrogenase activity / ketosteroid monooxygenase activity / progesterone metabolic process / daunorubicin metabolic process / doxorubicin metabolic process / bile acid binding / aldose reductase (NADPH) activity / prostaglandin metabolic process / steroid metabolic process / hippocampus development / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Bennett, M.J. / Schlegel, B.P. / Jez, J.M. / Penning, T.M. / Lewis, M. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structure of 3 alpha-hydroxysteroid/dihydrodiol dehydrogenase complexed with NADP+. 著者: Bennett, M.J. / Schlegel, B.P. / Jez, J.M. / Penning, T.M. / Lewis, M. #1: ![]() タイトル: Three-Dimensional Structure of Rat Liver 3 Alpha-Hydroxysteroid/Dihydrodiol Dehydrogenase: A Member of the Aldo-Keto Reductase Superfamily 著者: Hoog, S.S. / Pawlowski, J.E. / Alzari, P.M. / Penning, T.M. / Lewis, M. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 119.2 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 92.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 676.5 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 699 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 16.9 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 23.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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非結晶学的対称性 (NCS) | NCS oper: (Code: given Matrix: (0.999953, -0.003338, -0.009108), ベクター: |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 37078.547 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 詳細: FORMERLY EC 1.1.1.50, HOWEVER A NEW CONVENTION DISTINGUISHES THIS AS AN A CLASS DEHYDROGENASE 由来: (天然) ![]() ![]() #2: 化合物 | #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.15 Å3/Da / 溶媒含有率: 40 % | ||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 5.7 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射光源 | 波長: 1.5418 |
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検出器 | タイプ: RIGAKU / 検出器: IMAGE PLATE |
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.7→20 Å / Num. obs: 16123 / % possible obs: 90 % / 冗長度: 3 % / Rmerge(I) obs: 0.058 |
反射 | *PLUS Num. all: 17221 / Num. measured all: 53539 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.7→5 Å /
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原子変位パラメータ | Biso mean: 29 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.7→5 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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